233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0018 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  416  1e-115  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  97.55 
 
 
204 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  97.55 
 
 
204 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  87.25 
 
 
204 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  85.29 
 
 
204 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  84.31 
 
 
204 aa  360  9e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  84.8 
 
 
204 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  79.9 
 
 
204 aa  338  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  86.36 
 
 
176 aa  320  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  67 
 
 
204 aa  292  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  65.84 
 
 
204 aa  290  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  64.53 
 
 
204 aa  282  2e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  61.27 
 
 
204 aa  281  4e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  64.22 
 
 
211 aa  279  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  60.89 
 
 
208 aa  263  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  59.41 
 
 
206 aa  247  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  46.46 
 
 
203 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  46.46 
 
 
203 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  46.46 
 
 
203 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  43.94 
 
 
204 aa  172  3e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  42 
 
 
207 aa  171  8e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  45.96 
 
 
204 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.61 
 
 
204 aa  166  3e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  44.07 
 
 
204 aa  164  7e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  41.79 
 
 
204 aa  163  2e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  45.23 
 
 
205 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  45.23 
 
 
205 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  45.23 
 
 
205 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  45.23 
 
 
205 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  45.23 
 
 
205 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  44.95 
 
 
204 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  44.95 
 
 
204 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  44.95 
 
 
204 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  41.12 
 
 
203 aa  155  5e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  42.71 
 
 
207 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  42.27 
 
 
207 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  43.43 
 
 
204 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  43.43 
 
 
204 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  43.43 
 
 
204 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  43.43 
 
 
204 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  43.43 
 
 
204 aa  152  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  38.07 
 
 
205 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  39.59 
 
 
203 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  43.53 
 
 
205 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  42.71 
 
 
208 aa  146  2e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  43.59 
 
 
202 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  41.4 
 
 
242 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  42.35 
 
 
209 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.9 
 
 
198 aa  134  7e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  40.1 
 
 
210 aa  133  2e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  37.43 
 
 
219 aa  133  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.07 
 
 
211 aa  126  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  35.43 
 
 
201 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  31.61 
 
 
206 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  44.16 
 
 
274 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  37.25 
 
 
208 aa  119  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  34.43 
 
 
207 aa  117  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  35.45 
 
 
194 aa  117  1e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  5.82787e-07  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  34.01 
 
 
209 aa  116  2e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0592  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 
210 aa  114  1e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.655997 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  33.14 
 
 
198 aa  112  4e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  32 
 
 
198 aa  112  4e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  33.13 
 
 
201 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  35.42 
 
 
194 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.9 
 
 
210 aa  111  7e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  40.48 
 
 
198 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  34.98 
 
 
211 aa  108  7e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  34.18 
 
 
212 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.48 
 
 
290 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  32.31 
 
 
239 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  32.57 
 
 
200 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0695  hypothetical protein  46.81 
 
 
207 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  36.78 
 
 
211 aa  105  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  31.79 
 
 
194 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  33.88 
 
 
195 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  36.17 
 
 
194 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  1.02941e-11  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  36.17 
 
 
194 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  33.67 
 
 
213 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.74 
 
 
214 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  34.43 
 
 
195 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  34.43 
 
 
195 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  34.43 
 
 
195 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  39.24 
 
 
213 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  36.41 
 
 
211 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.36 
 
 
190 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.49 
 
 
211 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  36.9 
 
 
214 aa  102  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  39.22 
 
 
204 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  41.73 
 
 
225 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37.97 
 
 
245 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  33.51 
 
 
193 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.48018e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.98 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.48336e-11 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  31.98 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  31.98 
 
 
211 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  31.98 
 
 
211 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.47 
 
 
211 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  32.98 
 
 
194 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  31.98 
 
 
211 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>