232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2535 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  72.77 
 
 		 207 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  70.3 
 
 		 207 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  62 
 
 		 204 aa  261  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  52 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  52 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  52 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  56.73 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  50.5 
 
 		 204 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  54.24 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  49.25 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  57.54 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  48.7 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  52.55 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  43.35 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  48.59 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  50.75 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  50.75 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  50.75 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  44.39 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  50.75 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  50.25 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  44.44 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  50.25 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  50.25 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  50.25 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  50.25 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  50.25 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  50.25 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  50.25 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  50.25 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  50.75 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  40.91 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  42.44 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  42.49 
 
 		 204 aa  157  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  43.82 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  39.9 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  42.22 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  40.1 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  39.59 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  41.46 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  40.61 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  39.2 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  40.1 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  43.68 
 
 		 176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  40.68 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  44.12 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  41.38 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  38.31 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  40.11 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  43.68 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  39.15 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  40.22 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  34.24 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  39.2 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.41 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.06 
 
 		 198 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.3 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  36.42 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.25 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  37.84 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  33.86 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  35.75 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  33.01 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  37.44 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  36.32 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  35.26 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  37.43 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  37.33 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  32.61 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  31.72 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.07 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  36.41 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  32.07 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  43.41 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  32.07 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  40.22 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  31.75 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.04 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  38.6 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.97 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  31.52 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  31.52 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.52 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  31.52 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  31.52 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  37.43 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.52 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  38.22 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.28 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  35.38 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.27 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37.08 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  31.89 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  34.85 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.38 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>