More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0604 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  468  1e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  468  1e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 
224 aa  281  6e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  57.21 
 
 
229 aa  269  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 
219 aa  212  4e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.81 
 
 
223 aa  208  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
222 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 
258 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 
222 aa  204  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
228 aa  203  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
226 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
265 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 
220 aa  201  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
240 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.11909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  46.46 
 
 
226 aa  201  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 
224 aa  200  1e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.89 
 
 
221 aa  199  2e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 
224 aa  197  8e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.81 
 
 
224 aa  197  1e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 
224 aa  197  1e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 
224 aa  197  1e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 
220 aa  197  2e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
224 aa  196  2e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
224 aa  197  2e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 
225 aa  196  2e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 
221 aa  196  2e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 
224 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 
224 aa  195  5e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 
221 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  42.92 
 
 
220 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 
224 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.34276e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
223 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 
227 aa  192  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
235 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
224 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
228 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
224 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
236 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  44.59 
 
 
219 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
223 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  4.06961e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
225 aa  192  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 
228 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 
228 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 
223 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  43.48 
 
 
226 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
233 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 
224 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
225 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
263 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 
231 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 
652 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.04 
 
 
225 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  42.54 
 
 
228 aa  189  3e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.54 
 
 
226 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 
248 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  46.27 
 
 
229 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 
227 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 
224 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
228 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4465  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.27 
 
 
206 aa  187  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0436659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  41.23 
 
 
223 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.53 
 
 
225 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.61 
 
 
222 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  6.30157e-05 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
227 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
225 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 
228 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
232 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 
223 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 
224 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
249 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  42.48 
 
 
232 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.54 
 
 
226 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  41.07 
 
 
252 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4710  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 
224 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 
248 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
224 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  42.11 
 
 
226 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 
225 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 
230 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  43.61 
 
 
225 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.54 
 
 
226 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  42.15 
 
 
238 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 
226 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.85 
 
 
225 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 
225 aa  185  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 
224 aa  185  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.98 
 
 
226 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  43.81 
 
 
221 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.54 
 
 
226 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.52174e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.73 
 
 
224 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 
225 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 
225 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  43.61 
 
 
225 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 
225 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  42.54 
 
 
226 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 
224 aa  184  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 
223 aa  184  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  42.15 
 
 
223 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 
240 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1241  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 
247 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>