207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  100 
 
 		 445 aa  929    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.72 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  29.11 
 
 		 467 aa  206  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  29.68 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  30.02 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  31.03 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  28.22 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  30.42 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  29.55 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  26.85 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  29 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  28.34 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  29.41 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  29.41 
 
 		 451 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  30.75 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  30.13 
 
 		 445 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  30.45 
 
 		 469 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  27.39 
 
 		 441 aa  159  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  28.05 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  28.05 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.75 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  27.51 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  29.49 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  29.56 
 
 		 458 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  26.98 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  29.12 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  29.12 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  29.19 
 
 		 744 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  28.14 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.95 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  28.4 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  27.56 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  26.67 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  27.12 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  25.66 
 
 		 507 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  27.95 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.44 
 
 		 455 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  26.8 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  27.68 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  27.13 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  28.44 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  26.82 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  27.85 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  27.85 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  27.85 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  27.27 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  27.59 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  28.97 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  27.53 
 
 		 411 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  27.97 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  27.21 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  25.81 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  28.53 
 
 		 425 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  27.68 
 
 		 416 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  24.5 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  28.35 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  27.86 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  25.28 
 
 		 429 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  25.87 
 
 		 417 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  24.24 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  26.67 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  24.72 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  26.36 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  25.75 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  26.37 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  22.53 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0168  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25 
 
 		 478 aa  57  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0627386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3946  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  32.89 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0492  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  32.28 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1246  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.22 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0509  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  31.22 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.37 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1605  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  36.45 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  32.45 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1134  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  32.21 
 
 		 474 aa  53.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.03 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0488  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.52 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1880  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  33.33 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0292684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0161  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.04 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0240535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0182  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.91 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0120552  normal  0.632755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3569  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.14 
 
 		 488 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6171  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.94 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.0868865 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0587  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.93 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4218  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.14 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0387  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.14 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110933  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3742  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.14 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113506  hitchhiker  0.000000337645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0409  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.84 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0959029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0945  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.74 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0411  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.42 
 
 		 489 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.95093  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3452  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.04 
 
 		 484 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0693  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.09 
 
 		 476 aa  50.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.319702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2723  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.09 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3088  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.37 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.47524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.75 
 
 		 467 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.417926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3772  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.47 
 
 		 458 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.99 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2843  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.09 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0355  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.62 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1111  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.82 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  26.32 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>