215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2488 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  100 
 
 		 383 aa  761    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  39.07 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  38.96 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  34.51 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  39.18 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  36.79 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  36.94 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  35.08 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  37.26 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  35.19 
 
 		 366 aa  202  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  34.78 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  33.98 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  32.16 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  35.93 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  35.43 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  34.68 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  32.35 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  32.89 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  32.77 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  33.06 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  31.32 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  32.8 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  33.42 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  33.6 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  33.88 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  33.16 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  30.6 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  34.15 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  33.25 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  32.79 
 
 		 364 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  30.05 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  32.11 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  33.94 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  29.41 
 
 		 373 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.83 
 
 		 370 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  31.82 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  33.98 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  32.44 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  31.96 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  29.26 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  33.43 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  29.46 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  30.14 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  30.83 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  35.78 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  32.79 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  30.67 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  32.68 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  29.78 
 
 		 375 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  33.13 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  28.3 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  28.74 
 
 		 396 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  28.77 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  28.3 
 
 		 342 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  31.87 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  27.75 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  30.85 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  29.27 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  30.75 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  30.16 
 
 		 376 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  26.99 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  26.99 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  33.02 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  28.48 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  28.35 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  29.75 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  29.13 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  29.61 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  30.46 
 
 		 413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  28.87 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  29.71 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  29.16 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  28.44 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  27.68 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  24.45 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  32.14 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  28.65 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  29.06 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  26.91 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  27.81 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  28.61 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  31.03 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  39.1 
 
 		 301 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  33.33 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  27.84 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  28.14 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  29.14 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  28.85 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05941  Zn-dependent proteases  22.93 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06021  Zn-dependent protease  23.35 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  25.6 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0538  hypothetical protein  24.03 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.428838  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  26.03 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  38.15 
 
 		 285 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  28.15 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  35.9 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>