121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1082 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  93.39 
 
 
476 aa  900  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  93.39 
 
 
476 aa  901  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  93.39 
 
 
476 aa  900  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  100 
 
 
473 aa  957  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  100 
 
 
473 aa  957  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  93.39 
 
 
540 aa  900  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  99.79 
 
 
473 aa  956  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  93.39 
 
 
540 aa  900  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  93.39 
 
 
476 aa  900  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  93.18 
 
 
476 aa  898  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  93.39 
 
 
476 aa  900  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  100 
 
 
473 aa  957  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  100 
 
 
473 aa  957  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2046  amino acid permease family protein  60.21 
 
 
496 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2332  amino acid permease family protein  60.21 
 
 
496 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1311  amino acid transporter  45.78 
 
 
516 aa  409  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.30405e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1695  amino acid transporter  38.33 
 
 
480 aa  347  4e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00330646  decreased coverage  1.25344e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  38.69 
 
 
492 aa  343  5e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.14764e-05  hitchhiker  7.09791e-10 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  25.53 
 
 
489 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  3.67074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  25.32 
 
 
489 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.95 
 
 
495 aa  176  1e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  25.95 
 
 
495 aa  175  2e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  26.54 
 
 
507 aa  128  2e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  23.06 
 
 
477 aa  122  1e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 
477 aa  122  1e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  23.06 
 
 
477 aa  122  2e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  23.06 
 
 
477 aa  122  2e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  23.06 
 
 
477 aa  122  2e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  23.06 
 
 
477 aa  122  2e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  25.35 
 
 
498 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 
477 aa  120  4e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  25.12 
 
 
498 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 
496 aa  120  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 
500 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  22.63 
 
 
500 aa  116  8e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  22.63 
 
 
489 aa  116  9e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  22.63 
 
 
514 aa  116  1e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  22.41 
 
 
514 aa  114  4e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  23.34 
 
 
477 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  22.41 
 
 
500 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1217  amino acid permease family protein  22.46 
 
 
540 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  22.1 
 
 
500 aa  113  8e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  22.41 
 
 
514 aa  112  1e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 
501 aa  112  1e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  22.03 
 
 
540 aa  110  4e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4615  inner membrane transporter YjeM  22.74 
 
 
500 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  22.74 
 
 
500 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  22.74 
 
 
500 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  22.74 
 
 
500 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4742  inner membrane transporter YjeM  22.99 
 
 
493 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  21.71 
 
 
502 aa  103  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 
497 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  24.31 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  23.65 
 
 
473 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  23.65 
 
 
473 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 
497 aa  86.7  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  24.06 
 
 
467 aa  86.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  23.23 
 
 
476 aa  83.6  7e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  23.23 
 
 
470 aa  83.6  8e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  24.4 
 
 
464 aa  81.6  3e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  24.4 
 
 
464 aa  80.9  4e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 
495 aa  77  7e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 
480 aa  74.3  5e-12  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56631e-10 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  23.11 
 
 
472 aa  73.9  6e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  24.26 
 
 
474 aa  73.6  8e-12  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  24.26 
 
 
474 aa  73.2  1e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  23.9 
 
 
475 aa  72.8  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  22.8 
 
 
499 aa  72.4  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 
481 aa  72  2e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  23.47 
 
 
472 aa  72.4  2e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 
474 aa  70.5  6e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.2 
 
 
511 aa  69.3  1e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  21.99 
 
 
500 aa  68.9  2e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.2 
 
 
511 aa  68.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  22.2 
 
 
511 aa  68.9  2e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.2 
 
 
511 aa  68.9  2e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  20.99 
 
 
476 aa  68.9  2e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.2 
 
 
511 aa  68.9  2e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  22.2 
 
 
511 aa  68.9  2e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  22.2 
 
 
511 aa  68.9  2e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  22.2 
 
 
511 aa  68.9  2e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  22.2 
 
 
511 aa  68.9  2e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  23.75 
 
 
485 aa  68.2  3e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  19.44 
 
 
472 aa  67.8  4e-10  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 
490 aa  67.8  4e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  23.88 
 
 
485 aa  67.8  5e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 
469 aa  66.6  8e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  23.29 
 
 
466 aa  66.6  9e-10  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  21.95 
 
 
500 aa  65.9  1e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  1.96904e-05 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  21.71 
 
 
494 aa  66.2  1e-09  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  23.38 
 
 
473 aa  65.5  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  23.38 
 
 
473 aa  65.5  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  23.38 
 
 
473 aa  65.5  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  23.38 
 
 
473 aa  65.5  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  21.14 
 
 
455 aa  65.1  3e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  23.97 
 
 
473 aa  65.1  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  21.36 
 
 
494 aa  65.1  3e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  22.91 
 
 
475 aa  63.9  5e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  19.46 
 
 
511 aa  60.8  5e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 
508 aa  58.9  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>