More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0131 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  52.08 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  51.5 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  49.49 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  51.32 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  45.16 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  48.17 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  43.15 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  42.75 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.88 
 
 		 345 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  44.94 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  44.61 
 
 		 344 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  40.48 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  40.2 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  41.73 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  42.57 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  41.29 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  43.24 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  37.92 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  42.97 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  37.16 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  40.68 
 
 		 300 aa  215  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  38.32 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.78 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  37.76 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  38.18 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  36.27 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  40.46 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.15 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  36.96 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  39.92 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  35.47 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  39.22 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  37.31 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  34.72 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  57.86 
 
 		 469 aa  178  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  33.59 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  35.97 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 296 aa  148  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.3 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  34.26 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  33.59 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.96 
 
 		 349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  33.09 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  32.37 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  32.37 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  32.62 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  32.62 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.17 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.17 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  32.01 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  33.2 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  31.48 
 
 		 318 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  32.71 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  30.83 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  29.97 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  30.4 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  31.63 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  30.4 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  33.08 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  30.43 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  27.45 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  30.43 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 368 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  28.78 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  33.62 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  29.64 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 		 353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 318 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  27.94 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  27.53 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>