64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0257 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  100 
 
 
117 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  94.87 
 
 
117 aa  233  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  94.02 
 
 
117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  80.34 
 
 
117 aa  207  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  79.49 
 
 
117 aa  204  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  80.67 
 
 
119 aa  199  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  77.78 
 
 
117 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  83.62 
 
 
117 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  82 
 
 
101 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  51.75 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  47.37 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  38.84 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  42.06 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  38.46 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  36.89 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  39.34 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  39.62 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  37.61 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  35 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  37.61 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  33.33 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  33.7 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  31.09 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  36.52 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  36.61 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  42.17 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  29.52 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  38.75 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  31.87 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  35.05 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  38.75 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  28.85 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  35 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  31.93 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  27.97 
 
 
118 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  32.98 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  32 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.62 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  33.33 
 
 
588 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.81 
 
 
596 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.81 
 
 
596 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.81 
 
 
597 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.81 
 
 
596 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.81 
 
 
596 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  29.7 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  26.17 
 
 
596 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  37.97 
 
 
165 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.05 
 
 
596 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.05 
 
 
596 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  29.03 
 
 
596 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.12 
 
 
596 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.05 
 
 
596 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.05 
 
 
596 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  30.97 
 
 
589 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  43.9  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  27.06 
 
 
596 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.77 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.47 
 
 
583 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  34.09 
 
 
591 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.77 
 
 
596 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  41.07 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.289863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>