233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0022 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  98.04 
 
 
204 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  98.04 
 
 
204 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  84.31 
 
 
204 aa  360  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  84.31 
 
 
204 aa  357  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  83.82 
 
 
204 aa  357  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  97.73 
 
 
176 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  82.84 
 
 
204 aa  352  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  78.92 
 
 
204 aa  329  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  65.52 
 
 
204 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  64.36 
 
 
204 aa  281  5e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  63.55 
 
 
204 aa  275  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  61.76 
 
 
211 aa  271  4e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  58.33 
 
 
204 aa  267  9e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  59.41 
 
 
208 aa  256  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  58.91 
 
 
206 aa  245  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  45.45 
 
 
203 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  45.45 
 
 
203 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  45.45 
 
 
203 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  45.45 
 
 
204 aa  174  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  44.95 
 
 
204 aa  171  6e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  40.61 
 
 
207 aa  169  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  45.2 
 
 
204 aa  163  2e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  44.95 
 
 
204 aa  163  2e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  161  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  161  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  161  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  161  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  46.23 
 
 
205 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  46.24 
 
 
204 aa  160  8e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  45.96 
 
 
204 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  45.96 
 
 
204 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  45.96 
 
 
204 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  44.69 
 
 
204 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  41.41 
 
 
203 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  152  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  40.4 
 
 
203 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  43.68 
 
 
205 aa  147  2e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  39.47 
 
 
207 aa  145  4e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  43.59 
 
 
202 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.56 
 
 
205 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  42.21 
 
 
208 aa  141  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  41.4 
 
 
242 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  42.56 
 
 
209 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  41.46 
 
 
210 aa  134  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  38.42 
 
 
198 aa  132  4e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  35.2 
 
 
219 aa  130  1e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.15 
 
 
211 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.65 
 
 
206 aa  119  2e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  38.04 
 
 
274 aa  119  4e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  32 
 
 
207 aa  118  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  37.81 
 
 
208 aa  117  1e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  34.09 
 
 
201 aa  116  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.92 
 
 
210 aa  113  2e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  112  4e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.28 
 
 
214 aa  111  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  35.14 
 
 
195 aa  110  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  37.84 
 
 
194 aa  110  1e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.39 
 
 
198 aa  110  2e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  31.96 
 
 
201 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0695  hypothetical protein  40.23 
 
 
207 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0592  protein of unknown function UPF0029  36.5 
 
 
210 aa  108  8e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.655997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  34.54 
 
 
195 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  36.22 
 
 
194 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  5.82787e-07  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  34.54 
 
 
195 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  34.54 
 
 
195 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  32.96 
 
 
212 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  35.2 
 
 
211 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  35.05 
 
 
195 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  38.38 
 
 
194 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  1.02941e-11  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  38.38 
 
 
194 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  37.66 
 
 
190 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  31.38 
 
 
198 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  33.52 
 
 
211 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  34.46 
 
 
239 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  32.31 
 
 
194 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  34.54 
 
 
195 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.08 
 
 
213 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  44.83 
 
 
225 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  33.15 
 
 
211 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.52 
 
 
198 aa  101  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40.85 
 
 
245 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  33.16 
 
 
290 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.36 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  32.09 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.73 
 
 
211 aa  99  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.84 
 
 
211 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  29.89 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  33.51 
 
 
195 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  34.24 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  35.83 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  34.78 
 
 
303 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  34.78 
 
 
303 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  34.24 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>