More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0713 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0713  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
621 aa  1144    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0771  NADH dehydrogenase (quinone)  83.66 
 
 
621 aa  685    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6224  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4493  NADH dehydrogenase (quinone)  61.9 
 
 
597 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747238  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.97 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.017865  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4496  NADH dehydrogenase (quinone)  59.2 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1701  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  56.92 
 
 
626 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0803269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.59 
 
 
624 aa  209  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.32 
 
 
654 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  31.16 
 
 
654 aa  204  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.54 
 
 
654 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.05 
 
 
656 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.15 
 
 
678 aa  193  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.14 
 
 
628 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.2 
 
 
667 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  30.3 
 
 
686 aa  186  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  33.41 
 
 
643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.66 
 
 
634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.15 
 
 
625 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  24.91 
 
 
614 aa  185  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  30.7 
 
 
692 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  30.77 
 
 
686 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.17 
 
 
641 aa  183  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1937  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.2 
 
 
637 aa  183  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34876  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.93 
 
 
639 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  29.62 
 
 
695 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
670 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  33.74 
 
 
701 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  29.6 
 
 
686 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  27.12 
 
 
636 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3293  NADH dehydrogenase subunit L  30.55 
 
 
617 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  34.04 
 
 
697 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.27 
 
 
630 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.28 
 
 
651 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.14 
 
 
639 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.14 
 
 
639 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.14 
 
 
639 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.09 
 
 
645 aa  180  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4988  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.47 
 
 
736 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5217  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  29.17 
 
 
693 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  28.14 
 
 
668 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  34.13 
 
 
669 aa  179  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1866  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  32.99 
 
 
610 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.81 
 
 
674 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  30.7 
 
 
650 aa  178  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  31.72 
 
 
683 aa  178  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.24 
 
 
687 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.33 
 
 
671 aa  177  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.66 
 
 
676 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.7 
 
 
618 aa  177  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  33.43 
 
 
689 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.34 
 
 
675 aa  177  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  33.1 
 
 
620 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.74 
 
 
726 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  29.31 
 
 
670 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.58 
 
 
725 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  31.4 
 
 
685 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1518  NADH dehydrogenase subunit L  27.01 
 
 
613 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.282876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  33.09 
 
 
604 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.44 
 
 
733 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  33.09 
 
 
620 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  34.88 
 
 
617 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.19 
 
 
652 aa  174  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.48 
 
 
653 aa  174  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.46 
 
 
642 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1977  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.52 
 
 
665 aa  173  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  32.63 
 
 
695 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.58 
 
 
671 aa  173  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
620 aa  173  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
620 aa  173  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  32.89 
 
 
688 aa  173  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  28.3 
 
 
691 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.49 
 
 
669 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0151  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  28.04 
 
 
673 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.14 
 
 
637 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.33 
 
 
681 aa  173  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.13 
 
 
656 aa  172  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  33.09 
 
 
620 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  34.42 
 
 
617 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  33.02 
 
 
620 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  31.72 
 
 
688 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0207  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.92 
 
 
652 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306376  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.51 
 
 
678 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  33.24 
 
 
697 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  33.1 
 
 
620 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  29.47 
 
 
657 aa  171  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  29.47 
 
 
657 aa  171  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0320  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.74 
 
 
666 aa  171  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.63 
 
 
672 aa  171  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0672  NADH dehydrogenase (quinone)  33.94 
 
 
645 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922518  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  34.29 
 
 
620 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.18 
 
 
667 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  26.68 
 
 
612 aa  170  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
620 aa  170  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  29.3 
 
 
653 aa  170  8e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  29.39 
 
 
653 aa  170  8e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.29 
 
 
639 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.05 
 
 
679 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.05 
 
 
658 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  26.68 
 
 
610 aa  169  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01681  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.32 
 
 
673 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>