More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4493 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4493  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
597 aa  1112    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747238  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.71 
 
 
611 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.017865  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0713  NADH dehydrogenase (quinone)  62.48 
 
 
621 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0771  NADH dehydrogenase (quinone)  62.96 
 
 
621 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6224  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4496  NADH dehydrogenase (quinone)  58.15 
 
 
611 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1701  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  52.86 
 
 
626 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0803269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.46 
 
 
656 aa  205  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.37 
 
 
628 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  31.96 
 
 
654 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.47 
 
 
642 aa  203  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.51 
 
 
634 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.55 
 
 
654 aa  200  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.93 
 
 
654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  30.85 
 
 
636 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1866  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  33.33 
 
 
610 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.05 
 
 
625 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  30.43 
 
 
643 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.42 
 
 
678 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.79 
 
 
653 aa  190  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.64 
 
 
672 aa  190  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.46 
 
 
667 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  26.2 
 
 
614 aa  188  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.41 
 
 
624 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  27.66 
 
 
636 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.55 
 
 
637 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  28.57 
 
 
650 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  28.93 
 
 
620 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.28 
 
 
630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.19 
 
 
641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  28.47 
 
 
620 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  27.38 
 
 
679 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  27.55 
 
 
679 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  27.55 
 
 
679 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.25 
 
 
671 aa  185  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  27.38 
 
 
679 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  27.38 
 
 
679 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  27.38 
 
 
679 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  27.38 
 
 
679 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  28.78 
 
 
621 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  28.47 
 
 
620 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.69 
 
 
675 aa  183  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  30.25 
 
 
642 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1160  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.04 
 
 
671 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.37 
 
 
631 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  33.42 
 
 
653 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.08 
 
 
673 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.67 
 
 
666 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  27.46 
 
 
686 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  31.17 
 
 
620 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.75 
 
 
639 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  31.17 
 
 
604 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  33.42 
 
 
653 aa  181  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  26.94 
 
 
682 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  28.83 
 
 
685 aa  181  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  28.39 
 
 
620 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  31.39 
 
 
620 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  31.87 
 
 
620 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  32.6 
 
 
620 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.01 
 
 
639 aa  180  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.2 
 
 
675 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  26.96 
 
 
596 aa  179  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.33 
 
 
652 aa  179  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  30.49 
 
 
666 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.21 
 
 
642 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  27.02 
 
 
686 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  32.71 
 
 
666 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.43 
 
 
686 aa  179  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4156  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.99 
 
 
676 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.44 
 
 
678 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  32.67 
 
 
719 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  27.94 
 
 
692 aa  178  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  27.51 
 
 
670 aa  177  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.74 
 
 
685 aa  177  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  26.25 
 
 
596 aa  177  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  32.12 
 
 
620 aa  177  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.21 
 
 
667 aa  176  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.94 
 
 
671 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.85 
 
 
627 aa  176  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.93 
 
 
683 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  33.41 
 
 
701 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.74 
 
 
639 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4909  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.52 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.82 
 
 
666 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.24 
 
 
691 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  29.61 
 
 
688 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  26.68 
 
 
686 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1518  NADH dehydrogenase subunit L  27.16 
 
 
613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.282876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  26.78 
 
 
692 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.07 
 
 
710 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.48 
 
 
676 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.72 
 
 
678 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  32.02 
 
 
669 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.62 
 
 
681 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.33 
 
 
676 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.85 
 
 
656 aa  174  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  31.62 
 
 
669 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  32.72 
 
 
689 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  32.77 
 
 
683 aa  174  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.06 
 
 
667 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  26.03 
 
 
684 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>