More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3679 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
611 aa  1133    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.017865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4493  NADH dehydrogenase (quinone)  52.76 
 
 
597 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747238  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4496  NADH dehydrogenase (quinone)  54.28 
 
 
611 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0713  NADH dehydrogenase (quinone)  54.76 
 
 
621 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1701  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  54.8 
 
 
626 aa  356  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0803269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0771  NADH dehydrogenase (quinone)  52.37 
 
 
621 aa  335  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6224  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  30.52 
 
 
620 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.88 
 
 
654 aa  238  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  31.53 
 
 
654 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.05 
 
 
624 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.61 
 
 
654 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.76 
 
 
656 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  30.65 
 
 
620 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  29.64 
 
 
620 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.05 
 
 
628 aa  227  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  29.89 
 
 
620 aa  227  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  29.89 
 
 
620 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  29.36 
 
 
636 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  29.25 
 
 
620 aa  224  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  29.09 
 
 
620 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  30.7 
 
 
620 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.77 
 
 
645 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.56 
 
 
630 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  33.12 
 
 
620 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.21 
 
 
634 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  32.91 
 
 
620 aa  219  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4733  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.17 
 
 
689 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0478983  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  30.38 
 
 
614 aa  216  8e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1336  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.43 
 
 
690 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  33.4 
 
 
669 aa  213  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  34.19 
 
 
686 aa  212  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.7 
 
 
678 aa  212  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  29.12 
 
 
668 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1937  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.22 
 
 
637 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34876  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.24 
 
 
667 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.4 
 
 
670 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.38 
 
 
651 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.48 
 
 
675 aa  211  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  27.96 
 
 
691 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  29.84 
 
 
650 aa  210  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0672  NADH dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 
645 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922518  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  28.68 
 
 
687 aa  210  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  33.25 
 
 
657 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  33.25 
 
 
657 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.05 
 
 
627 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  33.04 
 
 
604 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  28.27 
 
 
686 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.72 
 
 
642 aa  209  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.52 
 
 
639 aa  209  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.21 
 
 
725 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.65 
 
 
653 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.66 
 
 
639 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.66 
 
 
639 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.66 
 
 
639 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  34.48 
 
 
669 aa  207  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  29.32 
 
 
695 aa  207  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  32.75 
 
 
634 aa  207  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5217  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  28.71 
 
 
693 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.36 
 
 
669 aa  206  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  32.01 
 
 
621 aa  206  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.76 
 
 
673 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  32.24 
 
 
654 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  29.25 
 
 
695 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
679 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
679 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
679 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.98 
 
 
672 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.24 
 
 
660 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.73 
 
 
670 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  28.97 
 
 
692 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  31.77 
 
 
642 aa  204  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1515  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  28.8 
 
 
668 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.98 
 
 
674 aa  204  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  31.35 
 
 
636 aa  204  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1058  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.46 
 
 
652 aa  204  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  31.97 
 
 
686 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1357  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.13 
 
 
688 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592157  normal  0.205396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  32.33 
 
 
691 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.697145  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4024  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  32.33 
 
 
693 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  36 
 
 
653 aa  203  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  36 
 
 
653 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.79 
 
 
671 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  33.16 
 
 
692 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  28.66 
 
 
696 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.88 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.6 
 
 
650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.5 
 
 
652 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  35.06 
 
 
701 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.43 
 
 
726 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
670 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  35.8 
 
 
697 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.98 
 
 
676 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  28.71 
 
 
682 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.4 
 
 
642 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  28.66 
 
 
679 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  28.66 
 
 
679 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  28.66 
 
 
679 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  28.66 
 
 
679 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  30.12 
 
 
638 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1977  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.81 
 
 
665 aa  200  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>