More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1627 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  40.65 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  40.08 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  36.03 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  38.46 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  37.08 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  36.03 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  37.04 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  34.55 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  37.56 
 
 		 349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.56 
 
 		 727 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  33.64 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  38.01 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.56 
 
 		 728 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.89 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  37.56 
 
 		 305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  37.56 
 
 		 306 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  37.56 
 
 		 305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.56 
 
 		 728 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  35.25 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.88 
 
 		 728 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  36.65 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  38.07 
 
 		 346 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  38.07 
 
 		 346 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.88 
 
 		 751 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34.39 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.18 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.27 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  36.93 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  34.56 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.2 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  32.94 
 
 		 728 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  32.57 
 
 		 308 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  32.55 
 
 		 728 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  34.39 
 
 		 358 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  35.84 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  31.89 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  34.39 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  35.04 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  34.39 
 
 		 347 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  34.39 
 
 		 306 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  34.39 
 
 		 474 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  34.39 
 
 		 347 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  33.94 
 
 		 318 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  32.54 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  33.94 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  34.52 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.94 
 
 		 319 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  34.09 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.67 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  32.56 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  33.86 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  34.56 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.73 
 
 		 740 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  30.85 
 
 		 733 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  32.26 
 
 		 346 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.19 
 
 		 358 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  35.32 
 
 		 323 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  32.09 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  34.78 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  38.64 
 
 		 275 aa  121  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  35.75 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  33.75 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  35.75 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  36.78 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.56 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  31.45 
 
 		 760 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  28.86 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  26.88 
 
 		 767 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  33.33 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.84 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  32.53 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.16 
 
 		 315 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.41 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.02 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  30.17 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  29.92 
 
 		 323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  37.29 
 
 		 335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  35.76 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  30.04 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  35.8 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  35.59 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  37.78 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  28.05 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  28.05 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.66 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.66 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  31.88 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.56 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  28.9 
 
 		 740 aa  111  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.09 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  30.09 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  29.3 
 
 		 581 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.09 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  31.41 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.09 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.63 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  37.71 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.63 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>