More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0374 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  49.43 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  48.61 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  51.43 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  49.38 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  45.33 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  53.03 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  43.21 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  43.21 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  44.59 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  44.29 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  39.51 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  45.33 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  44.59 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  36.76 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>