More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1179 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  76.55 
 
 		 552 aa  846    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  100 
 
 		 556 aa  1129    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  57.5 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  44.37 
 
 		 573 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  44.82 
 
 		 573 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  45.24 
 
 		 559 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  44.09 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  44.65 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  43.03 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  43.21 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  43.21 
 
 		 579 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  43.03 
 
 		 579 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  43.03 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  43.21 
 
 		 579 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  42.86 
 
 		 579 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  43.39 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  43.03 
 
 		 579 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  43.03 
 
 		 579 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  40.72 
 
 		 562 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 		 567 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 		 558 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 		 559 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 570 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 		 559 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  38.04 
 
 		 551 aa  365  1e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 565 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 565 aa  359  8e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.02 
 
 		 565 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 562 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 		 554 aa  350  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 		 557 aa  349  8e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 		 558 aa  347  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  36.93 
 
 		 577 aa  347  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  35.2 
 
 		 552 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 		 580 aa  342  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 		 588 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  34.61 
 
 		 561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.61 
 
 		 578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.05 
 
 		 553 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.89 
 
 		 560 aa  336  7.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.68 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.1 
 
 		 572 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.72 
 
 		 554 aa  330  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  35.49 
 
 		 601 aa  326  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 565 aa  325  9e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  35.61 
 
 		 586 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 588 aa  324  3e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 574 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.87 
 
 		 553 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.02 
 
 		 560 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34 
 
 		 554 aa  323  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  34.23 
 
 		 553 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  34.23 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  34.23 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  34.23 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  34.23 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 558 aa  322  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.09 
 
 		 553 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  32 
 
 		 551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 553 aa  319  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.87 
 
 		 553 aa  319  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  33.87 
 
 		 553 aa  319  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.87 
 
 		 553 aa  319  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.87 
 
 		 553 aa  319  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 553 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 553 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 553 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 553 aa  318  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.57 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  34.59 
 
 		 553 aa  317  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.13 
 
 		 554 aa  317  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.44 
 
 		 599 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 553 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 		 587 aa  313  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 		 557 aa  313  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.13 
 
 		 553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  35.42 
 
 		 560 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 557 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 542 aa  310  5e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 		 572 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.97 
 
 		 608 aa  309  9e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 561 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  33 
 
 		 605 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 556 aa  307  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.01 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  34.17 
 
 		 553 aa  307  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 557 aa  306  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  33.94 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.32 
 
 		 552 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>