More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1664 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  66.45 
 
 		 164 aa  219  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  66.45 
 
 		 164 aa  219  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  45.1 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  45.1 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.75 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  45.75 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  45.75 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  45.75 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  45.1 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.44 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  45.1 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  44.9 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.1 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  45.14 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  38.26 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  42.36 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  33.76 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  39.07 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  47.75 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  38.76 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  38.81 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  38.03 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  31.01 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  37.78 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  42.31 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  36.3 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  39.55 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  33.83 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  36.24 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  35.26 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  36.89 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  36.42 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  34.93 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  39.83 
 
 		 160 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.76 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  34.23 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  39.83 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.14 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.66 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  34.23 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  35.33 
 
 		 161 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  38.06 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  37.67 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  34.23 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  35.21 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  36.43 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  36.43 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  37.31 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  34.01 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  33.08 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  34.07 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  36.03 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  36.84 
 
 		 140 aa  91.3  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  35.33 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  35.14 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  37.32 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  34.31 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  35.11 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  38.17 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  34.75 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  33.76 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  39.44 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf806  hypothetical protein  45.38 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  40.16 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37.7 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  34.51 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  29.66 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  40.95 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  34.88 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  38.84 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  34.88 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  36.96 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  38.74 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  37.8 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  39.32 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  33.09 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  34.9 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.59 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  33.59 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  31.43 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  32.12 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  39.13 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>