More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0118 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0118  ribokinase  100 
 
 		 303 aa  630  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  54.79 
 
 		 306 aa  352  2.9999999999999997e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  43.43 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  42.76 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  42.76 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  43.43 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  42.76 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  42.42 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  42.76 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.2 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.66 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.54 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  34.24 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  33.55 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  34.98 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  35.22 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  35.88 
 
 		 305 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  34.44 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  34.32 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  34.32 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  33 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  34.98 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  38.31 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  32.78 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  33.44 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.54 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  33.11 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  34.85 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  34.24 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  33.55 
 
 		 302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  34.78 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  38.1 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  33.33 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  33.22 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  32.55 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  33.66 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  37.09 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  34.77 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  34.17 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  34.77 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  34.77 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  34.77 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  34.77 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  34 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  38.78 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  35.57 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  34.44 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  30.91 
 
 		 345 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  33.55 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  35.43 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  34.38 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  33.88 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  33.22 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  34.01 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  35.14 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  32.56 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  32.67 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  33.44 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  33.77 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.55 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  31.72 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  32.04 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  33.55 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  31.56 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  33.99 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  32.45 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  31.76 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  31.56 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  32.45 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  33.33 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  33.22 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  32.89 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  32.89 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  33.33 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  33.01 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  33.33 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  32.67 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  30.29 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  32.89 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.36 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  33.55 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  33.56 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  31.48 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  31.89 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  33.33 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  34.36 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  32.76 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  32.56 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  31.82 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  34.33 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  34.11 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  33.44 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>