More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2557 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  100 
 
 		 391 aa  766    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  63.66 
 
 		 375 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  56.99 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  51.86 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  54.89 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  51.63 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  48.74 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  48.74 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  43.05 
 
 		 481 aa  295  8e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.22 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  48.48 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  48.48 
 
 		 362 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.01 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.35 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.35 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  39.47 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.69 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.11 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  41.49 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  43.85 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  39.46 
 
 		 370 aa  275  9e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.67 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  39.47 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  39.47 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  42.12 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.32 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.33 
 
 		 430 aa  273  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.05 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  42.67 
 
 		 373 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  41.22 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  38.03 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.69 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  42.36 
 
 		 371 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  43.24 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  40.43 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.02 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.54 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  38.89 
 
 		 378 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.2 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  39.48 
 
 		 386 aa  258  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  39.48 
 
 		 386 aa  258  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.22 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  40.24 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  37.77 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.8 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.63 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  41.24 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.77 
 
 		 404 aa  255  9e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  38.03 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.38 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  37.3 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  37.3 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  37.5 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  39.01 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  37.27 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  38.83 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  38.83 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  37.83 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  40.05 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  41.1 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  38.56 
 
 		 371 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  40.05 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  46.17 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  38.56 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  38.56 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  38.56 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  42.29 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  38.56 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  38.56 
 
 		 382 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  38.56 
 
 		 382 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  38.62 
 
 		 378 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.73 
 
 		 374 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  37.07 
 
 		 374 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.07 
 
 		 374 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  38.3 
 
 		 382 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  37.53 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.26 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.83 
 
 		 378 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.6 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  38.99 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  38.07 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  38.07 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.33 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  36.29 
 
 		 381 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.8 
 
 		 374 aa  245  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  38.07 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  36.41 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  36.29 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  36.55 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  37.53 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  37.97 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  38.34 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  36.96 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  36.44 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.03 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  39.58 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  38.83 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  38.83 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  36.97 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  39.07 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>