More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1868 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1868  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
267 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
269 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
259 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.33 
 
 
260 aa  99  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.64 
 
 
265 aa  99  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 
290 aa  95.9  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  33.92 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.05 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.52 
 
 
260 aa  92.4  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.43 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
290 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2497  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
262 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.91 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
262 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0702  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  33.66 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
270 aa  89.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.95 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.14 
 
 
259 aa  89.4  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
260 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2500  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
288 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
270 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
259 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
296 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
270 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
263 aa  88.6  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 
268 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.67 
 
 
260 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0400  short chain enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
270 aa  88.2  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0904838  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02896  mitochondrial methylglutaconyl-CoA hydratase (Auh), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11480)  35.36 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2982  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.74 
 
 
687 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0217709  normal  0.0895723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2822  cyclohexa-1,5-dienecarbonyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 
294 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3797  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.75 
 
 
649 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
253 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.26 
 
 
260 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  33.14 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.58 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  33.49 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  40.22 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.3 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.96 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.54 
 
 
267 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.05 
 
 
659 aa  85.9  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
285 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
256 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.55 
 
 
654 aa  85.5  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
252 aa  85.5  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
269 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 
259 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.36 
 
 
663 aa  85.1  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  28.22 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  29.78 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>