82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0684 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  100 
 
 
167 aa  330  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  56.44 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  54.6 
 
 
168 aa  161  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  50.31 
 
 
169 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  49.07 
 
 
169 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  49.07 
 
 
169 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  49.09 
 
 
169 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  54.78 
 
 
169 aa  156  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  48.47 
 
 
168 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  47.83 
 
 
169 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  47.85 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  50.6 
 
 
169 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  47.56 
 
 
169 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  48.21 
 
 
169 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  46.06 
 
 
169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  47.85 
 
 
169 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  45.4 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  44.38 
 
 
167 aa  127  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  41.51 
 
 
167 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1411  OsmC family protein  36.88 
 
 
153 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.431224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  42.27 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  38.74 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  35.9 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  29.25 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  35.96 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  33.03 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  32.74 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  31.11 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  35.78 
 
 
202 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  35.33 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  32.19 
 
 
206 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  36.79 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  37.25 
 
 
199 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  26.22 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  28.14 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  35 
 
 
202 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32.71 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  31.13 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  31.82 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  31.19 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  30.28 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  34.65 
 
 
148 aa  54.7  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  29.09 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  31.19 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  29.41 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  42.47 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  29.36 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  29.36 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  30.28 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  30.28 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  34.44 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.08 
 
 
189 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  36.47 
 
 
182 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  29.36 
 
 
184 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  36.47 
 
 
182 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  30.28 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  30 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  29.17 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  30.93 
 
 
200 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  28.97 
 
 
187 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  36.56 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  29.52 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0349  OsmC family protein  36.36 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  28.44 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  27.52 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  27 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  29.52 
 
 
183 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  29.01 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  34.29 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  28.04 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  29.52 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  25.71 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  30.95 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  31.68 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1788  hypothetical protein  28.91 
 
 
137 aa  42  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  26.74 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  31.73 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  29.63 
 
 
176 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  29.63 
 
 
176 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  29.63 
 
 
176 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  28.28 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>