117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2073 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  100 
 
 		 239 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  78.24 
 
 		 239 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  77.41 
 
 		 239 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  44.68 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  39.75 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  34.41 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  34.85 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  38.37 
 
 		 464 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 390 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  37.45 
 
 		 390 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  28.4 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  30.71 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 398 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 392 aa  98.6  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 391 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 392 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  38.38 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.81 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.81 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  36.63 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  33.02 
 
 		 314 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  25.34 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.62 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  38.26 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  31.58 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  39.6 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  24.72 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.12 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  32.62 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  28.24 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  28.16 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  28.24 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  34.12 
 
 		 449 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.32 
 
 		 399 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.45 
 
 		 321 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 321 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 321 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  28.16 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  30.94 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  41.67 
 
 		 434 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  29.37 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  30.17 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  31.54 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  32.65 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  29.69 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.38 
 
 		 386 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  30.63 
 
 		 274 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  30 
 
 		 524 aa  43.5  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  24.71 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1487  methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  34.91 
 
 		 351 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  31.63 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  31.03 
 
 		 348 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.74 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  36.28 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>