More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2180 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  63.45 
 
 		 307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  64.14 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  63.64 
 
 		 300 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  62.29 
 
 		 300 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  62.24 
 
 		 297 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  60.88 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  62.12 
 
 		 313 aa  363  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  56.9 
 
 		 306 aa  335  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  55.56 
 
 		 296 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  56.36 
 
 		 319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  41.5 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  40.5 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  34.28 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  36.68 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  33.22 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  38.64 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  38.4 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  34.22 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  36.9 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  33.21 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  31.89 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  32.98 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  32.23 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  30.48 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  26.55 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  27.95 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  26.76 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  27.7 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  30.48 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  27.43 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  27.94 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  26.28 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  25.74 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  25.9 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  24.45 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.65 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  24.56 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  29.2 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  23.86 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.09 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93830  predicted protein  30.39 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  27.72 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  23.33 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  23.81 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  26.43 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.43 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  23.99 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.19 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  25.95 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  25.28 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.11 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  26.41 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.19 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.99 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.46 
 
 		 425 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.65 
 
 		 393 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.65 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.28 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  23.68 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  27.46 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  28.26 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>