More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4229 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
445 aa  909  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  50.68 
 
 
447 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 
441 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 
452 aa  236  5e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
452 aa  166  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
436 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
466 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
733 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  26.85 
 
 
778 aa  139  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
782 aa  130  5e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
462 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
539 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
414 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
440 aa  114  4e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
413 aa  114  4e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
440 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  30.77 
 
 
413 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  25 
 
 
425 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
425 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
418 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
403 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  28.88 
 
 
403 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
415 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
924 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  26 
 
 
397 aa  93.6  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
394 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  22.15 
 
 
401 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
404 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
409 aa  85.5  2e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  30.05 
 
 
442 aa  84.7  3e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
410 aa  84  5e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
426 aa  82  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
414 aa  81.6  3e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
404 aa  80.9  4e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
428 aa  80.5  5e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
391 aa  79.7  8e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
415 aa  79.3  1e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
402 aa  79  1e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
1303 aa  79.3  1e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  8.53282e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
800 aa  79  2e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
392 aa  78.2  2e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
401 aa  77.8  3e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
426 aa  76.6  7e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
418 aa  76.6  8e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
375 aa  76.6  8e-13  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  19.28 
 
 
442 aa  75.9  2e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
346 aa  75.5  2e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.2 
 
 
388 aa  74.7  3e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.15 
 
 
400 aa  74.7  3e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
379 aa  74.7  3e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  31 
 
 
355 aa  74.3  4e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
378 aa  74.3  4e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
899 aa  74.3  4e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
386 aa  73.9  5e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
409 aa  73.9  6e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
405 aa  73.2  8e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
384 aa  73.2  9e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
386 aa  72.4  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
393 aa  72.8  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.37 
 
 
380 aa  72.4  1e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  25 
 
 
384 aa  72.4  1e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.53 
 
 
412 aa  72.8  1e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
689 aa  72.4  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
401 aa  71.6  2e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 
393 aa  72  2e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  2.09107e-10 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
1301 aa  72  2e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
426 aa  71.6  3e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
378 aa  70.9  4e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
404 aa  70.9  4e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 
404 aa  70.9  5e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 
404 aa  70.9  5e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
397 aa  70.5  5e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
373 aa  70.5  6e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
396 aa  70.5  6e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
445 aa  70.1  7e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
403 aa  70.1  7e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  23.85 
 
 
401 aa  70.1  8e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
396 aa  70.1  8e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 
1220 aa  69.7  9e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
463 aa  69.3  1e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
390 aa  69.3  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0201  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
399 aa  69.7  1e-10  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00670088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
397 aa  68.6  2e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
391 aa  68.9  2e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
412 aa  68.6  2e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
381 aa  68.6  2e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
820 aa  68.9  2e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
372 aa  68.6  2e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.13 
 
 
407 aa  68.6  2e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
370 aa  68.6  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
382 aa  68.2  3e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
372 aa  68.2  3e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
420 aa  68.2  3e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
364 aa  67.8  4e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  2.26756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  30.59 
 
 
424 aa  67.8  4e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
406 aa  67.4  4e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.94 
 
 
468 aa  67.8  4e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>