283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0443 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  78.84 
 
 		 286 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  66.89 
 
 		 292 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  66.55 
 
 		 292 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  72.87 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  64.84 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  61.27 
 
 		 300 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  64.14 
 
 		 285 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  63.71 
 
 		 295 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  63.29 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  63.29 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  63.29 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  63.29 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  63.29 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  63.29 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  62.87 
 
 		 292 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  65.82 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  64.56 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  64.56 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  64.56 
 
 		 285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  64.56 
 
 		 303 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  64.14 
 
 		 295 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  64.14 
 
 		 295 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  49.15 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  45.93 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  44.03 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  49.17 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  47.26 
 
 		 303 aa  215  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  44.19 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  47.06 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  43.31 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  43.03 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  39.08 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  40.76 
 
 		 236 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  40.79 
 
 		 239 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  40.08 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  40.37 
 
 		 218 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  34.45 
 
 		 244 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  35.81 
 
 		 240 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  31.97 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  30.86 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.2 
 
 		 243 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  26.16 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  36.11 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.74 
 
 		 237 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  33.74 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  38.57 
 
 		 217 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  34.23 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  36.2 
 
 		 233 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  27.94 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.47 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  29.75 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.12 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.57 
 
 		 241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  30.83 
 
 		 242 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  26.82 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  28.44 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.28 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  29.22 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.83 
 
 		 227 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  30.23 
 
 		 224 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  28.27 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  25.57 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  33.18 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  28.44 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  29.11 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  24.68 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  28.46 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  33.18 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  30.56 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  30.04 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  35.68 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  30.14 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  30.94 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.15 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.15 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.46 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.7 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  29.72 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  32.34 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  26.27 
 
 		 226 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  32.34 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  31.1 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  29.66 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  33.17 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  41.03 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  31.07 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  27.73 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  35.22 
 
 		 240 aa  99.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.03 
 
 		 238 aa  99  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  25.76 
 
 		 234 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  30.67 
 
 		 228 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  30.25 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  24.79 
 
 		 239 aa  96.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.08 
 
 		 254 aa  96.3  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  29.08 
 
 		 235 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  36.91 
 
 		 228 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  21.79 
 
 		 237 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>