More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0413 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  52.85 
 
 		 752 aa  770    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  51.11 
 
 		 755 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 762 aa  1575    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  52.29 
 
 		 752 aa  766    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  52.43 
 
 		 752 aa  766    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  46.98 
 
 		 758 aa  691    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  42.45 
 
 		 770 aa  602  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  40.72 
 
 		 724 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  40.52 
 
 		 1180 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  40.95 
 
 		 1228 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  43.54 
 
 		 1173 aa  545  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  39.64 
 
 		 746 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  39.64 
 
 		 746 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  39.35 
 
 		 757 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  40.59 
 
 		 1171 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  39.44 
 
 		 1176 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.48 
 
 		 734 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.42 
 
 		 727 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  40.52 
 
 		 729 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  39.75 
 
 		 716 aa  512  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  37.58 
 
 		 831 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  40.3 
 
 		 744 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  37.45 
 
 		 829 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  37.45 
 
 		 829 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  39.56 
 
 		 908 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4763  nitrate reductase catalytic subunit  36.09 
 
 		 831 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1019  nitrate reductase catalytic subunit  36.82 
 
 		 838 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  35.83 
 
 		 831 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  39.64 
 
 		 1188 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  37.33 
 
 		 829 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  36.33 
 
 		 831 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  36.86 
 
 		 829 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  36.86 
 
 		 829 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  35.83 
 
 		 829 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1453  periplasmic nitrate reductase, large subunit  37.14 
 
 		 828 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  36.98 
 
 		 829 aa  502  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3343  nitrate reductase catalytic subunit  37.14 
 
 		 828 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.139665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0735  nitrate reductase catalytic subunit  37.14 
 
 		 828 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2354  nitrate reductase catalytic subunit  37.14 
 
 		 828 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2344  nitrate reductase catalytic subunit  37.14 
 
 		 828 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2981  nitrate reductase catalytic subunit  36.16 
 
 		 834 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237893  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49250  nitrate reductase catalytic subunit  37.37 
 
 		 834 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.562968  normal  0.0276876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  37.02 
 
 		 829 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1444  nitrate reductase catalytic subunit  37.14 
 
 		 828 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2505  nitrate reductase catalytic subunit  37.01 
 
 		 828 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02133  nitrate reductase, periplasmic, large subunit  37.01 
 
 		 828 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.976817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.14 
 
 		 907 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5180  nitrate reductase catalytic subunit  36.67 
 
 		 834 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  35.27 
 
 		 837 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  36.62 
 
 		 827 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  37.07 
 
 		 829 aa  498  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3206  nitrate reductase catalytic subunit  36.27 
 
 		 827 aa  498  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4205  nitrate reductase catalytic subunit  37.37 
 
 		 834 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02092  hypothetical protein  37.01 
 
 		 828 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.961372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  40.31 
 
 		 908 aa  499  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  36.15 
 
 		 831 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2983  nitrate reductase catalytic subunit  36.81 
 
 		 827 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1057  nitrate reductase catalytic subunit  36.15 
 
 		 832 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1913  nitrate reductase catalytic subunit  36.93 
 
 		 829 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463649  normal  0.796386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  39.83 
 
 		 906 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  38.53 
 
 		 958 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.05 
 
 		 929 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  39.76 
 
 		 952 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.54 
 
 		 952 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3148  nitrate reductase catalytic subunit  37.12 
 
 		 826 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0848  nitrate reductase catalytic subunit  36.99 
 
 		 826 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3486  nitrate reductase catalytic subunit  36.92 
 
 		 828 aa  492  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000513  periplasmic nitrate reductase precursor  35.79 
 
 		 829 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  35.86 
 
 		 831 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3990  nitrate reductase catalytic subunit  36.7 
 
 		 831 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.774592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2715  nitrate reductase catalytic subunit  36.55 
 
 		 828 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05377  nitrate reductase catalytic subunit  35.67 
 
 		 829 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2938  nitrate reductase catalytic subunit  36.31 
 
 		 835 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2174  nitrate reductase catalytic subunit  34.95 
 
 		 831 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.642457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  40.86 
 
 		 879 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0623  nitrate reductase catalytic subunit  36.4 
 
 		 826 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2499  nitrate reductase catalytic subunit  35.87 
 
 		 828 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.444552  hitchhiker  0.00117092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2485  nitrate reductase catalytic subunit  35.99 
 
 		 828 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2602  nitrate reductase catalytic subunit  35.74 
 
 		 828 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.475066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2394  nitrate reductase catalytic subunit  35.87 
 
 		 828 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1343  nitrate reductase catalytic subunit  36.39 
 
 		 851 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.511379 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1508  nitrate reductase catalytic subunit  36.07 
 
 		 827 aa  488  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2443  nitrate reductase catalytic subunit  35.87 
 
 		 828 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.556235 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2411  nitrate reductase catalytic subunit  36.68 
 
 		 828 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3515  nitrate reductase catalytic subunit  36.33 
 
 		 837 aa  485  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0949945  hitchhiker  0.00218526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4110  nitrate reductase catalytic subunit  36.31 
 
 		 826 aa  485  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3957  nitrate reductase catalytic subunit  36.31 
 
 		 826 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  38.66 
 
 		 931 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.35 
 
 		 904 aa  485  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  38.14 
 
 		 946 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0859  nitrate reductase catalytic subunit  36.68 
 
 		 831 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0617  nitrate reductase catalytic subunit  36.12 
 
 		 829 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0824  nitrate reductase catalytic subunit  36.34 
 
 		 831 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  39.89 
 
 		 1313 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  39.39 
 
 		 906 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  39.08 
 
 		 901 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  39.78 
 
 		 1409 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3222  nitrate reductase catalytic subunit  35.47 
 
 		 828 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  39.92 
 
 		 1407 aa  482  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  35.84 
 
 		 834 aa  482  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>