More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2983 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0623  nitrate reductase catalytic subunit  88.63 
 
 		 826 aa  1506    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02133  nitrate reductase, periplasmic, large subunit  71.58 
 
 		 828 aa  1266    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.976817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1453  periplasmic nitrate reductase, large subunit  71.58 
 
 		 828 aa  1268    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1018  nitrate reductase catalytic subunit  49.73 
 
 		 924 aa  829    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1913  nitrate reductase catalytic subunit  70.89 
 
 		 829 aa  1258    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463649  normal  0.796386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3957  nitrate reductase catalytic subunit  88.63 
 
 		 826 aa  1513    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3165  nitrate reductase catalytic subunit  71.65 
 
 		 831 aa  1252    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  72.98 
 
 		 829 aa  1272    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1057  nitrate reductase catalytic subunit  73.53 
 
 		 832 aa  1275    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0847  nitrate reductase catalytic subunit  91.05 
 
 		 831 aa  1546    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.22751 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0871  nitrate reductase catalytic subunit  49.14 
 
 		 924 aa  844    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0848  nitrate reductase catalytic subunit  90.33 
 
 		 826 aa  1552    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3206  nitrate reductase catalytic subunit  91.17 
 
 		 827 aa  1570    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2715  nitrate reductase catalytic subunit  72.67 
 
 		 828 aa  1281    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  73.34 
 
 		 829 aa  1303    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3990  nitrate reductase catalytic subunit  68 
 
 		 831 aa  1180    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.774592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3511  nitrate reductase catalytic subunit  90.57 
 
 		 831 aa  1539    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1444  nitrate reductase catalytic subunit  71.7 
 
 		 828 aa  1269    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2411  nitrate reductase catalytic subunit  72.79 
 
 		 828 aa  1284    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2485  nitrate reductase catalytic subunit  71.46 
 
 		 828 aa  1264    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0724  periplasmic nitrate reductase, large subunit  49.63 
 
 		 929 aa  848    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0824  nitrate reductase catalytic subunit  90.57 
 
 		 831 aa  1561    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3515  nitrate reductase catalytic subunit  71.24 
 
 		 837 aa  1249    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0949945  hitchhiker  0.00218526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4763  nitrate reductase catalytic subunit  70 
 
 		 831 aa  1248    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2505  nitrate reductase catalytic subunit  71.7 
 
 		 828 aa  1268    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2438  nitrate reductase catalytic subunit  68.74 
 
 		 839 aa  1214    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02092  hypothetical protein  71.58 
 
 		 828 aa  1266    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.961372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2844  nitrate reductase catalytic subunit  69.06 
 
 		 838 aa  1221    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  72.87 
 
 		 831 aa  1305    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4116  nitrate reductase catalytic subunit  67.59 
 
 		 831 aa  1176    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.568266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2443  nitrate reductase catalytic subunit  71.34 
 
 		 828 aa  1263    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.556235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4110  nitrate reductase catalytic subunit  88.39 
 
 		 826 aa  1512    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2394  nitrate reductase catalytic subunit  71.34 
 
 		 828 aa  1263    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  69.55 
 
 		 834 aa  1209    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1716  nitrate reductase catalytic subunit  49.19 
 
 		 920 aa  836    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207825  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  73.1 
 
 		 829 aa  1273    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1514  nitrate reductase catalytic subunit  47.72 
 
 		 940 aa  808    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0000000749729  n/a   
 
 
 
NC_009784  VIBHAR_05377  nitrate reductase catalytic subunit  72.58 
 
 		 829 aa  1281    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2344  nitrate reductase catalytic subunit  71.7 
 
 		 828 aa  1269    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1273  nitrate reductase catalytic subunit  71.1 
 
 		 830 aa  1261    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1019  nitrate reductase catalytic subunit  65.46 
 
 		 838 aa  1164    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  72.98 
 
 		 829 aa  1273    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  68.75 
 
 		 831 aa  1215    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0868  nitrate reductase catalytic subunit  49.08 
 
 		 926 aa  829    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0859  nitrate reductase catalytic subunit  90.57 
 
 		 831 aa  1562    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  68.96 
 
 		 837 aa  1213    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2602  nitrate reductase catalytic subunit  71.22 
 
 		 828 aa  1263    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.475066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4009  nitrate reductase catalytic subunit  69.22 
 
 		 848 aa  1236    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2354  nitrate reductase catalytic subunit  71.7 
 
 		 828 aa  1269    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  68.96 
 
 		 827 aa  1226    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  72.17 
 
 		 829 aa  1261    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2791  nitrate reductase catalytic subunit  71.1 
 
 		 830 aa  1261    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0978398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  72.62 
 
 		 829 aa  1257    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2981  nitrate reductase catalytic subunit  69.81 
 
 		 834 aa  1214    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237893  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  69.76 
 
 		 831 aa  1241    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1928  nitrate reductase catalytic subunit  48.87 
 
 		 926 aa  821    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0438  nitrate reductase catalytic subunit  50.48 
 
 		 934 aa  861    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000251806  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3222  nitrate reductase catalytic subunit  71.26 
 
 		 828 aa  1236    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  50.24 
 
 		 770 aa  802    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4205  nitrate reductase catalytic subunit  69.2 
 
 		 834 aa  1214    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1770  nitrate reductase catalytic subunit  73.2 
 
 		 831 aa  1288    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000513  periplasmic nitrate reductase precursor  72.71 
 
 		 829 aa  1278    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1508  nitrate reductase catalytic subunit  68.64 
 
 		 827 aa  1202    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3343  nitrate reductase catalytic subunit  71.58 
 
 		 828 aa  1268    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.139665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0704  nitrate reductase catalytic subunit  91.05 
 
 		 826 aa  1542    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  73.1 
 
 		 829 aa  1269    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  73.1 
 
 		 829 aa  1269    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3318  nitrate reductase catalytic subunit  91.17 
 
 		 826 aa  1545    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0553  nitrate reductase catalytic subunit  85.85 
 
 		 827 aa  1494    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0735  nitrate reductase catalytic subunit  71.46 
 
 		 828 aa  1264    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2553  nitrate reductase catalytic subunit  72.65 
 
 		 829 aa  1286    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.4401  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  73.04 
 
 		 831 aa  1276    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2938  nitrate reductase catalytic subunit  66.63 
 
 		 835 aa  1175    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49250  nitrate reductase catalytic subunit  69.2 
 
 		 834 aa  1214    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.562968  normal  0.0276876 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1739  molybdopterin oxidoreductase  44.2 
 
 		 854 aa  669    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.0195226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1343  nitrate reductase catalytic subunit  69.56 
 
 		 851 aa  1227    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.511379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2499  nitrate reductase catalytic subunit  71.34 
 
 		 828 aa  1263    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.444552  hitchhiker  0.00117092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1387  nitrate reductase catalytic subunit  71.1 
 
 		 830 aa  1261    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1591  nitrate reductase catalytic subunit  68.82 
 
 		 837 aa  1192    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  72.62 
 
 		 829 aa  1261    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3430  nitrate reductase catalytic subunit  90.93 
 
 		 826 aa  1539    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1161  nitrate reductase catalytic subunit  48.6 
 
 		 925 aa  823    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0617  nitrate reductase catalytic subunit  73.43 
 
 		 829 aa  1290    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4721  nitrate reductase catalytic subunit  66.27 
 
 		 831 aa  1130    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.068762  normal  0.0333447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3148  nitrate reductase catalytic subunit  91.05 
 
 		 826 aa  1575    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0801  nitrate reductase catalytic subunit  49.03 
 
 		 923 aa  841    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.237228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  72.84 
 
 		 831 aa  1275    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2983  nitrate reductase catalytic subunit  100 
 
 		 827 aa  1724    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3486  nitrate reductase catalytic subunit  72.19 
 
 		 828 aa  1267    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5180  nitrate reductase catalytic subunit  66.99 
 
 		 834 aa  1165    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2174  nitrate reductase catalytic subunit  72.86 
 
 		 831 aa  1299    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.642457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07590  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  41.52 
 
 		 851 aa  630  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.676481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  39.57 
 
 		 758 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  38.49 
 
 		 755 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  38.03 
 
 		 752 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  37.55 
 
 		 752 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  37.91 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  36.05 
 
 		 762 aa  497  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  32.26 
 
 		 1228 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  32.79 
 
 		 1171 aa  358  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>