More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1687 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
275 aa  553  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  96.73 
 
 
275 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  81.41 
 
 
270 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  72.5 
 
 
280 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  73.78 
 
 
274 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  73.83 
 
 
288 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  72.32 
 
 
274 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  72.32 
 
 
274 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  54.18 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.69 
 
 
272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.45 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.31 
 
 
266 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.98 
 
 
264 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.56 
 
 
266 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.56 
 
 
266 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.17 
 
 
269 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  52.11 
 
 
269 aa  261  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.19 
 
 
266 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
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NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  52.16 
 
 
323 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  52.61 
 
 
267 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
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NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.46 
 
 
263 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  53.36 
 
 
282 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.78 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.16 
 
 
269 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  56.18 
 
 
272 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
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NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.42 
 
 
300 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  56.22 
 
 
271 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
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NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.87 
 
 
262 aa  244  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
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NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.37 
 
 
268 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  47.45 
 
 
271 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  44.35 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  44.31 
 
 
249 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  44.87 
 
 
271 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  43.48 
 
 
253 aa  205  7e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  43.13 
 
 
263 aa  204  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.75 
 
 
280 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.85 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  41.09 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  43.36 
 
 
289 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.36 
 
 
289 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
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NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  39.5 
 
 
296 aa  195  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.49 
 
 
263 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.3 
 
 
264 aa  185  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
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NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  42.97 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
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NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  35.88 
 
 
346 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
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NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  45.38 
 
 
255 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.15 
 
 
324 aa  178  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
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NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  40 
 
 
250 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  41.47 
 
 
279 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.51 
 
 
257 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  39.42 
 
 
241 aa  175  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.2 
 
 
468 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  37.07 
 
 
257 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  37.5 
 
 
268 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.5 
 
 
268 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  35.9 
 
 
267 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  37.31 
 
 
249 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.33 
 
 
253 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.53 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.97 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.93 
 
 
252 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  35.19 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.4 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.18 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.52 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.83 
 
 
262 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.33 
 
 
264 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.91 
 
 
251 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.83 
 
 
262 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  38.06 
 
 
368 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.91 
 
 
251 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.94 
 
 
262 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.91 
 
 
251 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.91 
 
 
251 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
248 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  36.12 
 
 
261 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.29 
 
 
259 aa  158  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.87 
 
 
253 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.58 
 
 
249 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  34.73 
 
 
271 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  36.96 
 
 
249 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  35.8 
 
 
249 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  36.58 
 
 
249 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  38.52 
 
 
262 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.52 
 
 
251 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  34.4 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.26 
 
 
253 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  35.63 
 
 
251 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  36.47 
 
 
250 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
266 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  36.57 
 
 
262 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.57 
 
 
262 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.14 
 
 
247 aa  153  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.45 
 
 
255 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.23 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.7 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.98 
 
 
259 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.98 
 
 
259 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.98 
 
 
259 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.98 
 
 
259 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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