More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1552 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
329 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  77.46 
 
 
323 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  75.52 
 
 
321 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  64.2 
 
 
324 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  58.33 
 
 
337 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  61.97 
 
 
336 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  61.62 
 
 
336 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  62.32 
 
 
334 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  60.92 
 
 
311 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  59.65 
 
 
300 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  55.32 
 
 
321 aa  353  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  56.75 
 
 
303 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  55.16 
 
 
284 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  55.87 
 
 
323 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  52.79 
 
 
315 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  54.84 
 
 
290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  53.19 
 
 
356 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  54.45 
 
 
284 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  54.8 
 
 
281 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  51.77 
 
 
283 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  52.46 
 
 
296 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  50.52 
 
 
306 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  52.48 
 
 
297 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  51.25 
 
 
284 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  51.94 
 
 
301 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  51.07 
 
 
289 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  51.05 
 
 
288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  53.02 
 
 
289 aa  299  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  47.25 
 
 
308 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.6 
 
 
639 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  49.65 
 
 
290 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  53.33 
 
 
287 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 
300 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  48.36 
 
 
323 aa  292  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  49.65 
 
 
293 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  49.3 
 
 
296 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 
290 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 
290 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 
290 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  49.65 
 
 
296 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  49.1 
 
 
296 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  50 
 
 
323 aa  289  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  51.42 
 
 
294 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  49.12 
 
 
293 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  50.7 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  46.96 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  49.48 
 
 
293 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  45.52 
 
 
283 aa  281  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  50.53 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  41.11 
 
 
303 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
290 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  39.15 
 
 
335 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 
296 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  41.36 
 
 
297 aa  218  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  41.9 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  40.7 
 
 
313 aa  212  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 
297 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  45 
 
 
409 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
320 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
302 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
291 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
294 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  28.67 
 
 
318 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
302 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
302 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
301 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
302 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  30.03 
 
 
308 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
339 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
339 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 
279 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  39.84 
 
 
279 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  51.58 
 
 
99 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  29.69 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  28.52 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
297 aa  96.3  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  41.23 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  40 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
282 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  37.96 
 
 
302 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
293 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
284 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  41.32 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  38.93 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  36.22 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>