More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1223 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  76.96 
 
 		 232 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  76.96 
 
 		 232 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  71.98 
 
 		 232 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 232 aa  342  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  71.12 
 
 		 232 aa  339  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 232 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 234 aa  338  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 234 aa  338  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  71 
 
 		 232 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  68.1 
 
 		 232 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  71 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  71 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  69.2 
 
 		 231 aa  334  7e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  65.95 
 
 		 234 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  66.06 
 
 		 230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  66.06 
 
 		 230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  57.21 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  52.97 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  47.98 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  43.24 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  45.54 
 
 		 255 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  47.03 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.12 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  45.33 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  45 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  45.33 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  45.33 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  44.59 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  44.8 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  43.05 
 
 		 242 aa  188  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  44.14 
 
 		 240 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  45.66 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  42.27 
 
 		 254 aa  187  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  43.52 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  45.7 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.81 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  42.73 
 
 		 247 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  43.3 
 
 		 247 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  43.89 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  41.89 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  45.21 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  42.08 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  43.61 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  41.44 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  45 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  44.7 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.79 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.79 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  45.33 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  40.97 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  43.98 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  42.31 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  39.91 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  44.39 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.91 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.13 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  43.78 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.96 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  42.2 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.96 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  40.72 
 
 		 249 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  41.18 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  41.41 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40.91 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.89 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  45.79 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  44.5 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.46 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  42.27 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  43.18 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.58 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  42.25 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  43.38 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  40.54 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  40.74 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  39.3 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  42.4 
 
 		 235 aa  174  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  43.17 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.71 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  41.26 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  40.91 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  41.52 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.89 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>