91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4060 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 327 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  86.81 
 
 		 327 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  58.2 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  54.46 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  48.99 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  42.39 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  42.39 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  42.36 
 
 		 301 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  37.16 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.17 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.34 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  35.52 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  31.79 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  37.3 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  38.22 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  32.35 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  34.88 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  30.61 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  36.39 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  34.9 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  31.46 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  34.22 
 
 		 268 aa  146  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 280 aa  146  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  35.37 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  31.23 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  33.55 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  36.39 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  31.39 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.99 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  32.4 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.99 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  33.57 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  33.86 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  32.49 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  32.94 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  31.51 
 
 		 483 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  28.12 
 
 		 473 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  28.43 
 
 		 498 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  32.08 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  34.12 
 
 		 180 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  30.17 
 
 		 503 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  29.46 
 
 		 472 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  34.39 
 
 		 482 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  35 
 
 		 481 aa  92.8  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  27.65 
 
 		 485 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  30.9 
 
 		 494 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  29.27 
 
 		 479 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  28.92 
 
 		 631 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  29.79 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  29.87 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  32.09 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  29.78 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  34.54 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  29.79 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  35.27 
 
 		 508 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  26.94 
 
 		 475 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  27.93 
 
 		 479 aa  79.3  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  25.17 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  40.38 
 
 		 124 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  29.1 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  33.85 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  28.72 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  33.51 
 
 		 498 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  28.67 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  22.5 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6496  UbiA prenyltransferase  23.67 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.99 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.99 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>