More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3190 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  81.24 
 
 		 543 aa  750    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3190  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 599 aa  1147    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000159661  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  39.66 
 
 		 525 aa  294  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 		 613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 514 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  32.4 
 
 		 521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  31.4 
 
 		 523 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  32.9 
 
 		 529 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  32.96 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  35.56 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  30.42 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.45 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  30.42 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  31 
 
 		 521 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  26.4 
 
 		 525 aa  178  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  31.07 
 
 		 511 aa  178  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  29.61 
 
 		 511 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  29.54 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  29.17 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  30.24 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  30.36 
 
 		 513 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  29.54 
 
 		 511 aa  173  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  30.2 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  30.66 
 
 		 515 aa  171  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  31.07 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  31.07 
 
 		 512 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  32.89 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  31.42 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  32.41 
 
 		 524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  29.61 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  29.8 
 
 		 516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  29.94 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  30.79 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  31.88 
 
 		 512 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  30.2 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 		 495 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  31.05 
 
 		 517 aa  163  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.11 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  30.32 
 
 		 505 aa  161  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  24.22 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 		 523 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  31.83 
 
 		 526 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  29.35 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  30.48 
 
 		 512 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  29.03 
 
 		 528 aa  157  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  24.2 
 
 		 523 aa  156  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 539 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  30.63 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  31.18 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.69 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 		 521 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  28.6 
 
 		 516 aa  154  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 		 530 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  30.89 
 
 		 573 aa  153  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  30.19 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  29.98 
 
 		 516 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1076  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 606 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  31.18 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  29.81 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2513  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 592 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0924  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 592 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0127  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 592 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  31.5 
 
 		 521 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 		 516 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 516 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 516 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  30.3 
 
 		 521 aa  150  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  29.13 
 
 		 545 aa  150  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 		 534 aa  150  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 		 526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 		 556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  29.9 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>