More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1881 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.96 
 
 
297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.49 
 
 
297 aa  295  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 
270 aa  262  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.29 
 
 
279 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.55 
 
 
296 aa  236  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  44.93 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
268 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  40.27 
 
 
294 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.32 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
301 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
297 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.5 
 
 
302 aa  205  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
275 aa  202  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 
277 aa  201  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  38.31 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
297 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
310 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
269 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  39.84 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
298 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
298 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
273 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
278 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  45.87 
 
 
290 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  40.52 
 
 
295 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  36.96 
 
 
278 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  37.97 
 
 
291 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  38.26 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  38.22 
 
 
277 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
311 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
270 aa  188  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.62 
 
 
273 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
275 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.98 
 
 
295 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
280 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
279 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 
277 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
284 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  37.5 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
306 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 
271 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
272 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
283 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000371485  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
275 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
280 aa  178  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
295 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
291 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
292 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.660216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  36.05 
 
 
304 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
279 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
301 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
246 aa  175  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
291 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  37.89 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
296 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
308 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
274 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  37.45 
 
 
280 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
271 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
271 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
290 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
300 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
277 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
279 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
294 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
302 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
294 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
277 aa  168  9e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
292 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
301 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
315 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
303 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
306 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
299 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
298 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
284 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.47 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  40.68 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
306 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
299 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
299 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
277 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>