More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1220 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  85.79 
 
 		 396 aa  679    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 413 aa  848    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.01 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.35 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.93 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.06 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.55 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  42.79 
 
 		 354 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  48.91 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  39.58 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  42.47 
 
 		 586 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  50.34 
 
 		 656 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.01 
 
 		 638 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  36.89 
 
 		 803 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  41.62 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  47.45 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  40.43 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  47.53 
 
 		 665 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  36.89 
 
 		 801 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.46 
 
 		 597 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.69 
 
 		 688 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  39.36 
 
 		 662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.69 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  39.9 
 
 		 492 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  36.54 
 
 		 597 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  41.25 
 
 		 596 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.17 
 
 		 155 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 		 257 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.83 
 
 		 171 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.07 
 
 		 206 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  35 
 
 		 722 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  32.13 
 
 		 601 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  40.25 
 
 		 601 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.91 
 
 		 455 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  33.95 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  36.87 
 
 		 600 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  40.13 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  38.5 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  40.1 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.64 
 
 		 407 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.5 
 
 		 177 aa  96.7  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  36.75 
 
 		 338 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  33.16 
 
 		 653 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.51 
 
 		 171 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  35.54 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  40.65 
 
 		 507 aa  93.2  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.33 
 
 		 170 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  38.14 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  31.65 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  34.04 
 
 		 642 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  33.01 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  36.7 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 635 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.05 
 
 		 628 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  37.21 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  36.05 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.06 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  33.7 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  38.13 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  35.82 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.98 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.81 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  35.98 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  38.61 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  34.67 
 
 		 654 aa  76.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  36.96 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  36.36 
 
 		 804 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.85 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  50.67 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  35.44 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.71 
 
 		 866 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.94 
 
 		 862 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  34.33 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  34.33 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5983  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.68 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.538368  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.33 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.33 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2244  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.84 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111887  decreased coverage  0.00847254 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  34.33 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  35.09 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  33.58 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.87 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  35.96 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.82 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 253 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  34.21 
 
 		 536 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.53 
 
 		 307 aa  57  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.57 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  32.46 
 
 		 503 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001253  hypothetical protein  33.09 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1853  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.94 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000197997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8626  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276752  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.99 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.94 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2588  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.94 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.424492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  30.77 
 
 		 503 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  30.72 
 
 		 520 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.29 
 
 		 139 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  31.3 
 
 		 568 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>