111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0118 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  76.19 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  47.53 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  51.69 
 
 		 249 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  46.74 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  38.5 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  37.16 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  35.34 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  35.38 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  35.97 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  37.66 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  37.98 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  35.74 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  34.4 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  34.53 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  31.37 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  32.86 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  34.21 
 
 		 222 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  32.23 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  33.04 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  33.04 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  36.31 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  29.55 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  36.11 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  32.64 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  31.36 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  40.15 
 
 		 200 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  32.09 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  33.12 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  40.46 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  32 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  32.95 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  39.68 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  32.39 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  30.93 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  35.29 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  34.08 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  34.48 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  35.29 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  34.52 
 
 		 218 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  31.4 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  33.93 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  34.71 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  36.84 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  36.84 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  37.21 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  28.69 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  28.69 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  36.43 
 
 		 217 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  32.38 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  38.21 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  31.82 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  32.7 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  35.88 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  32.08 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  31.2 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  32.74 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  32.74 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  32.29 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  29.33 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  32.34 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  29.75 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  30.89 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  33.86 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  29.44 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  28.22 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  31.39 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  34.38 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  28.22 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  28.11 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  31.48 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  31.08 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  39.73 
 
 		 114 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  30.22 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  31.7 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  32.48 
 
 		 333 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  34.69 
 
 		 402 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  26.89 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  36.56 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  29.41 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  32.17 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  36.56 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  37.78 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  36.56 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  37.78 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  37.78 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  30.99 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  31.13 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  26.8 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  39.13 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  27.57 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  27.93 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  37.68 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  30.3 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  32.39 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>