More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1374 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  100 
 
 		 344 aa  673    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  97.09 
 
 		 344 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  89.24 
 
 		 344 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  68.1 
 
 		 348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  62.9 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  59.59 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  58.43 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  58.05 
 
 		 351 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  54.84 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  54.89 
 
 		 352 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  50.58 
 
 		 354 aa  311  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  50.58 
 
 		 354 aa  311  6.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  50.15 
 
 		 340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  50.57 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  54.05 
 
 		 352 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  42.61 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  47.18 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  36.29 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  35.67 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  35.45 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  37.81 
 
 		 426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  35.86 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  37.33 
 
 		 480 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  38.69 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.23 
 
 		 427 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 386 aa  96.3  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 434 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.63 
 
 		 388 aa  95.9  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  39.17 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 		 376 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 		 438 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 421 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 		 439 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 		 370 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 		 374 aa  92.4  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  36.56 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 374 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 421 aa  89.7  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  37.72 
 
 		 417 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 422 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 385 aa  89.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 426 aa  89.4  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  31.78 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.91 
 
 		 419 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  35.93 
 
 		 406 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  30.09 
 
 		 382 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.5 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.17 
 
 		 423 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 422 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  31.56 
 
 		 426 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 437 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  31.09 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  33.09 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 370 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 437 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 367 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.73 
 
 		 401 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 446 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  38.07 
 
 		 443 aa  85.9  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 381 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 402 aa  85.9  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>