More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02343 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  100 
 
 		 417 aa  842    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  75.19 
 
 		 405 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  44.17 
 
 		 407 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  32.27 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 517 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  33.42 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 416 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  28 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  27.96 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  26.24 
 
 		 429 aa  123  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 		 413 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  24.74 
 
 		 413 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  29.22 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  32.12 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  26.34 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 422 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  21.8 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 457 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.33 
 
 		 409 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  25.5 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  25 
 
 		 397 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 415 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  27.39 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 904 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  19.01 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  30.95 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08730  glycosyltransferase  32.56 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510164  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  33.61 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.14 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  23.42 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  20.42 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  28.82 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  29.46 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  22.74 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  22.99 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>