54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00790 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  403  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  65.83 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  65.83 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  55.88 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  56.44 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  56.41 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  56.63 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  57.22 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  54.78 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  54.13 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  47.62 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  44.8 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  45.3 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  46.85 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0350  hypothetical protein  43.22 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3890  hypothetical protein  45.3 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.96639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4598  hypothetical protein  46.02 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  46.15 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  37.08 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  45.6 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  45.76 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3678  hypothetical protein  44.44 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0348  hypothetical protein  44.44 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  43.22 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4370  hypothetical protein  44.44 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  43.75 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0444  hypothetical protein  44.44 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0348  hypothetical protein  45.92 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0338  hypothetical protein  45.92 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0345  hypothetical protein  45.92 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0340  hypothetical protein  45.92 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3877  hypothetical protein  48.42 
 
 		 172 aa  95.5  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.524798 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  42.34 
 
 		 144 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  47.52 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004066  hypothetical protein  44.34 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  47.83 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  36.04 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.32 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  32.71 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0342  hypothetical protein  47.73 
 
 		 127 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.557264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  32.63 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  31.78 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  34.29 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  33.33 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  31.01 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  28 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  29.35 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  30.84 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  30.19 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  30.3 
 
 		 214 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  29.91 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  30.19 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>