More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3933 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  85.71 
 
 		 229 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  74.89 
 
 		 235 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  70.37 
 
 		 223 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  53.27 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.2 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  37.74 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  36.16 
 
 		 227 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  39.22 
 
 		 217 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  35.05 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.32 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.95 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  38.74 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  41.18 
 
 		 226 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.78 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  39.15 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  40.72 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  34.72 
 
 		 707 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  34.72 
 
 		 222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  40.21 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 728 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  37.93 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 707 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.82 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  34.9 
 
 		 714 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1217  HAD family sugar phosphatase  30.63 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  37.57 
 
 		 762 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.25 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  34.41 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  37.37 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  37.37 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  37.37 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  37.37 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  37.37 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  37.37 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.62 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  31.94 
 
 		 710 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.39 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.12 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.45 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.86 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.46 
 
 		 238 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  35.79 
 
 		 226 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  35.75 
 
 		 237 aa  98.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  37.13 
 
 		 232 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 216 aa  96.3  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 223 aa  95.5  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.7 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  35.19 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.87 
 
 		 233 aa  92  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  34.25 
 
 		 200 aa  92  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.13 
 
 		 217 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.6 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.55 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  33.18 
 
 		 213 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 219 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.65 
 
 		 217 aa  89.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  32.24 
 
 		 194 aa  89  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.5 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.38 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.65 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.5 
 
 		 221 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.91 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  32.61 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 202 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.86 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 223 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 202 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.23 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  33.71 
 
 		 218 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  27.55 
 
 		 211 aa  85.9  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.15 
 
 		 202 aa  85.5  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.81 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  34.54 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  34.84 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  34.84 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.01 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  28.12 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>