More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4043 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  75.4 
 
 		 388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  76.19 
 
 		 378 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  75.13 
 
 		 378 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  74.87 
 
 		 382 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  70.63 
 
 		 378 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  59.1 
 
 		 383 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  58.99 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  58.93 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  56.99 
 
 		 377 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  58.02 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  57.41 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  57.94 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  56.42 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  56.03 
 
 		 474 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  51.49 
 
 		 382 aa  339  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  51.83 
 
 		 381 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  51.83 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  46.83 
 
 		 377 aa  316  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  49.86 
 
 		 384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  49.07 
 
 		 379 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  45.38 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  51.09 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  46.38 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  46.61 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  49.59 
 
 		 394 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  44.1 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  46.93 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  46.5 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  45.37 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  44.15 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  44.21 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  40.49 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  43.98 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  44.95 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  42.94 
 
 		 366 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  44.44 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  40.59 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  40.92 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  39.01 
 
 		 368 aa  255  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  44.21 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  37.33 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  41.92 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  38.59 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  36.69 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  36.69 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.77 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  41.02 
 
 		 385 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  38.67 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  37.3 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  40.21 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  39.18 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  36.6 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  40.79 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  38.16 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  39.48 
 
 		 377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  40.6 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  39.23 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  32.43 
 
 		 373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  38.95 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  40.27 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  36.81 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  37.31 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  33.63 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  33.61 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  36.81 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  33.63 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  32.39 
 
 		 377 aa  205  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  33.04 
 
 		 369 aa  203  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  39.3 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  37.54 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  36.44 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  30.36 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.32 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  31.04 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  34.3 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  34.39 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  32.88 
 
 		 370 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  32.87 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.02 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.41 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  34.3 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  33.25 
 
 		 374 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  32.11 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  39.08 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  33.08 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  32.99 
 
 		 383 aa  176  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  33.94 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  34.76 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  33.69 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  41.86 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  37.98 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  32.72 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  41.08 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>