More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2336 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 		 625 aa  828    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 604 aa  823    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  80.06 
 
 		 623 aa  1034    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 604 aa  817    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  88.61 
 
 		 590 aa  1108    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  68.22 
 
 		 607 aa  847    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  74.53 
 
 		 595 aa  938    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 590 aa  648    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  91.02 
 
 		 590 aa  1130    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 591 aa  828    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 601 aa  636    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 591 aa  820    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  69.87 
 
 		 601 aa  883    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  72.79 
 
 		 596 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 606 aa  726    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  67.33 
 
 		 604 aa  826    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  93.73 
 
 		 590 aa  1165    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  66.55 
 
 		 593 aa  806    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 590 aa  644    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 		 591 aa  825    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  74.36 
 
 		 595 aa  931    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1218    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 623 aa  797    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  94.24 
 
 		 590 aa  1169    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  90.51 
 
 		 590 aa  1130    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 608 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 614 aa  824    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 594 aa  835    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 		 619 aa  762    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 593 aa  766    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  75.72 
 
 		 594 aa  937    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 591 aa  828    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  74.53 
 
 		 595 aa  938    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 605 aa  790    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  65.82 
 
 		 590 aa  826    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 599 aa  741    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  72.32 
 
 		 597 aa  895    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 604 aa  827    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  69.95 
 
 		 596 aa  884    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  92.71 
 
 		 591 aa  1157    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  72.45 
 
 		 596 aa  907    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  64.86 
 
 		 591 aa  810    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 		 595 aa  736    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  72.62 
 
 		 595 aa  903    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 609 aa  811    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 600 aa  631  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 605 aa  631  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 606 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 608 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 605 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 604 aa  624  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 581 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 588 aa  570  1e-161  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 600 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 597 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 589 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 603 aa  505  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 588 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 594 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 589 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 592 aa  493  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 591 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 591 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 591 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 591 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 594 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 591 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 591 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 598 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 591 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 592 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 589 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 617 aa  487  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 599 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 597 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 590 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 593 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 619 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 592 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 594 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 590 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 599 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 614 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 626 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 595 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 599 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 598 aa  477  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 604 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 614 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 591 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 598 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 592 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 594 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 627 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 610 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>