More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4374 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  60.03 
 
 
596 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 
604 aa  1078    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 
600 aa  687    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  98.01 
 
 
604 aa  1212    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
591 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 
595 aa  758    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 
595 aa  758    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
590 aa  828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
595 aa  748    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
590 aa  682    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  67.5 
 
 
590 aa  833    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  61.92 
 
 
599 aa  754    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
605 aa  643    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
591 aa  724    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
604 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
605 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  89.09 
 
 
625 aa  1132    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
608 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  67.72 
 
 
591 aa  839    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  71.96 
 
 
623 aa  925    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  64.57 
 
 
606 aa  768    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 
596 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  63.23 
 
 
595 aa  761    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  67 
 
 
590 aa  827    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 
593 aa  750    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
590 aa  686    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 
591 aa  720    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 
590 aa  833    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  67.66 
 
 
590 aa  836    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  85.76 
 
 
604 aa  1066    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
590 aa  832    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
623 aa  791    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 
609 aa  722    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
594 aa  707    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 
619 aa  764    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  63.71 
 
 
593 aa  762    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 
591 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 
594 aa  752    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 
596 aa  740    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
604 aa  1233    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 
605 aa  750    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 
595 aa  752    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
601 aa  749    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
608 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  99.83 
 
 
614 aa  1231    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 
597 aa  920    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 
606 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 
591 aa  726    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 
601 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
590 aa  734    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 
607 aa  802    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
588 aa  608  1e-173  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
581 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
600 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
603 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
588 aa  539  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
594 aa  529  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
589 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
598 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
592 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
589 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
591 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
597 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
591 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
613 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
599 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
599 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
597 aa  499  1e-140  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
591 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
591 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
586 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
590 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
592 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
594 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
591 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
592 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
594 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
591 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
619 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
617 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  44 
 
 
589 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
604 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
591 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
595 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
592 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
591 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
591 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
595 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
597 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
591 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
591 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
591 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
596 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
591 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
591 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
597 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
591 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
607 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>