More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2472 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 
623 aa  834    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
599 aa  732    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
625 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 
604 aa  724    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
600 aa  647    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 
595 aa  821    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  66.39 
 
 
595 aa  826    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
614 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
596 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
590 aa  660    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  67.06 
 
 
590 aa  833    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  66.39 
 
 
595 aa  826    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
591 aa  1220    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 
623 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
596 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  64.15 
 
 
601 aa  789    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  80.54 
 
 
590 aa  1004    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 
606 aa  729    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  65.6 
 
 
593 aa  790    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  66.04 
 
 
590 aa  825    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 
593 aa  743    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
590 aa  669    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  78.21 
 
 
591 aa  968    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 
590 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  67.06 
 
 
590 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  66.84 
 
 
590 aa  845    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 
595 aa  803    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
591 aa  1220    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  63.28 
 
 
609 aa  782    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  81.31 
 
 
594 aa  1014    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 
619 aa  759    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  67.45 
 
 
594 aa  834    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 
596 aa  802    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  61.94 
 
 
604 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 
595 aa  733    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  61.55 
 
 
597 aa  742    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
604 aa  715    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 
590 aa  832    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  62.62 
 
 
605 aa  772    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 
604 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  85.11 
 
 
591 aa  1048    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  95.77 
 
 
591 aa  1174    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  65 
 
 
607 aa  797    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  67.57 
 
 
591 aa  844    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
605 aa  628  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
588 aa  623  1e-177  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
604 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
605 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 
606 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
601 aa  601  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
608 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
581 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
603 aa  515  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
588 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
589 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
594 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
589 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
583 aa  487  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
600 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
592 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
590 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
583 aa  480  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
589 aa  481  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
586 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
619 aa  482  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
589 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
591 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
591 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
583 aa  475  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1981  aspartyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
585 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000379313  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
583 aa  478  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
597 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
592 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
591 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
591 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
591 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
591 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
591 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
591 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
590 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
591 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
595 aa  475  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
591 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
591 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
593 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
627 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
593 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
591 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
598 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
594 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
584 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
591 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
588 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
591 aa  465  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0653  aspartyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
582 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0244847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>