More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2557 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 596 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 600 aa  635    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 625 aa  712    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  63.55 
 
 		 595 aa  810    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 623 aa  722    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  63.55 
 
 		 595 aa  810    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 590 aa  657    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 		 590 aa  816    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 601 aa  775    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  62.75 
 
 		 596 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  63.28 
 
 		 591 aa  782    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 590 aa  757    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  62.81 
 
 		 599 aa  762    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 604 aa  706    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 		 606 aa  721    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 590 aa  810    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 593 aa  743    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 590 aa  650    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  61.74 
 
 		 591 aa  755    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 		 597 aa  727    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 590 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 604 aa  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 591 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  64.31 
 
 		 590 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 609 aa  1256    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 590 aa  809    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 596 aa  798    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 594 aa  769    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 619 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  65.35 
 
 		 594 aa  827    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  63.71 
 
 		 595 aa  812    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  58.71 
 
 		 604 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 595 aa  757    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  65.84 
 
 		 593 aa  796    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  64.34 
 
 		 605 aa  816    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  67.04 
 
 		 607 aa  841    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 595 aa  789    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  61.53 
 
 		 623 aa  793    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 590 aa  822    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  63.28 
 
 		 591 aa  782    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  59.16 
 
 		 604 aa  710    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 		 591 aa  774    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 		 614 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  64.64 
 
 		 591 aa  814    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 604 aa  630  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 605 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 605 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 601 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 606 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 588 aa  595  1e-169  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 608 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 581 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 588 aa  527  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 603 aa  505  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 589 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 589 aa  495  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 600 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 594 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 597 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 591 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 591 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 589 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 591 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 591 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 592 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 591 aa  482  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 594 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 593 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 619 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 592 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 591 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 592 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 594 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 590 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 589 aa  475  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 596 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 596 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 600 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 597 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 614 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 594 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 597 aa  468  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 593 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 606 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 598 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 604 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 595 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 590 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 586 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 594 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 579 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>