More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1543 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 581 aa  1199    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 590 aa  639    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 590 aa  632  1e-180  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 606 aa  628  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 619 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 593 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 599 aa  621  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 600 aa  606  9.999999999999999e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 625 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 597 aa  608  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 604 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 604 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 604 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 607 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 590 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 604 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 601 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 604 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 608 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 614 aa  581  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 588 aa  579  1e-164  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 591 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 606 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 605 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 608 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 605 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 590 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 590 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 590 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 590 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 590 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 605 aa  573  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 593 aa  571  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 623 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 591 aa  568  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 609 aa  558  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 595 aa  561  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 595 aa  561  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 595 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 596 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 596 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 595 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 596 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 600 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 592 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 590 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 598 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 598 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 609 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 598 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 603 aa  462  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 589 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 592 aa  458  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 588 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 594 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 588 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 583 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 1019 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 594 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 590 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0653  aspartyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 582 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0244847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 590 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 598 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 583 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 585 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 588 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 591 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 591 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 591 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 591 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 589 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 572 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 595 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 591 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 591 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 584 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 591 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 589 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 591 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 595 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 591 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 602 aa  443  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 579 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 591 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>