More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1627 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  84.6 
 
 		 383 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  93.49 
 
 		 383 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  82.8 
 
 		 377 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  80.16 
 
 		 377 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  72.94 
 
 		 377 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  58.93 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  57.03 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  56.12 
 
 		 378 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  55.61 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  55.67 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  56.08 
 
 		 378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  57.07 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  58.9 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  52.8 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  52.32 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  51.69 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  53.16 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  50 
 
 		 377 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  49.47 
 
 		 384 aa  345  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  50.26 
 
 		 379 aa  322  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  51.78 
 
 		 386 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  51.47 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  45.82 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  46.9 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  43.72 
 
 		 391 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  43.85 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  44.75 
 
 		 365 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  45.58 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  46.88 
 
 		 383 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  42.74 
 
 		 387 aa  282  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  46.09 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  45.73 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  44.81 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  40.8 
 
 		 370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  42.17 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  42.86 
 
 		 366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  39.95 
 
 		 373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  41.59 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  38.24 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  38.56 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  41.99 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  41.64 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  40.36 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  40.55 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  40.66 
 
 		 384 aa  242  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  39.15 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  41.44 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.25 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  41.32 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  40.6 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  39.09 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  40.33 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  40.06 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  35.09 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  38.18 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  36.68 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  32.73 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  38.15 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  32.1 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  31.05 
 
 		 376 aa  222  9e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  42.31 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  41.92 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  39.7 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  31.78 
 
 		 369 aa  216  8e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  32.07 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  32.07 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  33.15 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  33.15 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.88 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  35.34 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  35.2 
 
 		 380 aa  199  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  33.81 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  40.93 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  36.07 
 
 		 371 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.83 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  33.52 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  29.65 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  32.98 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  34.35 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  29.28 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  34.29 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  31.22 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  33.51 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  33.77 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  33.77 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.51 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  34.27 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  34.01 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  46.51 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  32.55 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  35.08 
 
 		 374 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  34.04 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  35.08 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  32.82 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  33.63 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  34.66 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  32.15 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  32.15 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>