More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0929 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.13 
 
 
809 aa  1007    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
796 aa  1622    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  64.68 
 
 
808 aa  1012    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  36.15 
 
 
731 aa  317  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  38.8 
 
 
958 aa  312  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
632 aa  306  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
733 aa  306  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  42.52 
 
 
602 aa  304  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 
1275 aa  303  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
709 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
709 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
783 aa  302  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 
1509 aa  301  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  37.35 
 
 
765 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
1334 aa  295  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
723 aa  294  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
625 aa  293  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
625 aa  293  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
784 aa  293  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 
625 aa  289  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 
1561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
576 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  37.47 
 
 
617 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 
586 aa  271  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
670 aa  270  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  40.79 
 
 
531 aa  266  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.32 
 
 
610 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 
775 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 
728 aa  265  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
1486 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  39.61 
 
 
710 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
684 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 
721 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  39.86 
 
 
526 aa  253  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
539 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
1152 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
1152 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
635 aa  250  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  38.93 
 
 
555 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 
653 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
717 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
746 aa  248  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
790 aa  249  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 
717 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
658 aa  248  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  39.08 
 
 
632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
551 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  46.3 
 
 
1359 aa  240  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
551 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  43.05 
 
 
1759 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
652 aa  238  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  37 
 
 
684 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
832 aa  234  4.0000000000000004e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  33.09 
 
 
810 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
729 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
880 aa  226  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
988 aa  226  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
794 aa  223  9e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  41.95 
 
 
662 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
1067 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
1991 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.69 
 
 
1182 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
556 aa  206  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  32.22 
 
 
1644 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  32.22 
 
 
1644 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
958 aa  197  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
996 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
857 aa  187  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
742 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
983 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
742 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
742 aa  183  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
732 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
1213 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
725 aa  180  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
725 aa  178  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
748 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
1084 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
1198 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  35.34 
 
 
972 aa  172  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
1193 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
1188 aa  169  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.86 
 
 
1191 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
1190 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.21 
 
 
1173 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
734 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
1297 aa  157  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  36.06 
 
 
1003 aa  155  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
1187 aa  151  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
1177 aa  145  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
1162 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
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NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  28.4 
 
 
1694 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
974 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  24.45 
 
 
783 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
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NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
968 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.57 
 
 
968 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
965 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  32.35 
 
 
1171 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 
510 aa  134  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
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NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  24.95 
 
 
2046 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
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