More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1609 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  90.69 
 
 
556 aa  969    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  69.41 
 
 
529 aa  739    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  69.4 
 
 
553 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  69.59 
 
 
555 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  74.49 
 
 
556 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  90.5 
 
 
556 aa  966    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
555 aa  1103    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  70.82 
 
 
559 aa  734    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  68.48 
 
 
533 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  90.88 
 
 
556 aa  970    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  70.32 
 
 
554 aa  729    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  47.51 
 
 
565 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  46.08 
 
 
562 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  40.14 
 
 
594 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 
566 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  39.75 
 
 
573 aa  354  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  39.65 
 
 
580 aa  352  7e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  41.33 
 
 
582 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  38.9 
 
 
595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  37.08 
 
 
563 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  36.1 
 
 
571 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
574 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 
574 aa  287  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  31.83 
 
 
570 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
574 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
577 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 
596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
577 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  30.78 
 
 
589 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  31.92 
 
 
572 aa  256  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  28.78 
 
 
569 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
571 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
574 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
569 aa  253  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 
599 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  29.95 
 
 
576 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  31.96 
 
 
571 aa  250  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 
606 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
585 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  32.11 
 
 
591 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
576 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
596 aa  239  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
621 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  32.68 
 
 
579 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
586 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  28.67 
 
 
590 aa  232  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  28.72 
 
 
580 aa  232  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
610 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  49.29 
 
 
705 aa  230  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 
548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 
605 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 
700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  29.97 
 
 
465 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
483 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.4 
 
 
747 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.1 
 
 
666 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
761 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.47 
 
 
598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
469 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
479 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
466 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
502 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  30.94 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  31.94 
 
 
790 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.85 
 
 
667 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
479 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.45 
 
 
1110 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  28.46 
 
 
325 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 
557 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
479 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  27.21 
 
 
472 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.18 
 
 
627 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.58 
 
 
602 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  32.4 
 
 
614 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
626 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
502 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  31.43 
 
 
1032 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.6 
 
 
880 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  30.04 
 
 
425 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
582 aa  106  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1671  protein kinase  34.55 
 
 
301 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.18 
 
 
586 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.92 
 
 
287 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
982 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.24 
 
 
850 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  37.22 
 
 
352 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 
1415 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
651 aa  105  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
982 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  30.28 
 
 
399 aa  104  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
783 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.57 
 
 
863 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 
381 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>