More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1830 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  95.2 
 
 		 354 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  94.92 
 
 		 354 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  92.94 
 
 		 354 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  75.07 
 
 		 353 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  72.8 
 
 		 354 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  71.95 
 
 		 354 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  65.54 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  58.97 
 
 		 352 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  58.74 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  57.18 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  56.27 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  55.33 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  53.47 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  56.69 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  54.42 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  53.54 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  58.33 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  58.33 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  58.33 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  58.33 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  58.33 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  57.1 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  58.33 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  51.29 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  55.04 
 
 		 350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  57.72 
 
 		 352 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  55.04 
 
 		 353 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  58.33 
 
 		 374 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  55.04 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  55.04 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  54.44 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  53.64 
 
 		 365 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  54.76 
 
 		 355 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  55.81 
 
 		 350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  51.45 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  56.1 
 
 		 381 aa  349  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  56.1 
 
 		 352 aa  348  7e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  54.15 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  54.2 
 
 		 358 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  51.58 
 
 		 351 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  51.9 
 
 		 371 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  51.3 
 
 		 384 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  48.44 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  51.31 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  47.71 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  48.52 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  47.71 
 
 		 372 aa  309  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  48.1 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  42.27 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  46.08 
 
 		 373 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  46.37 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  43.11 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  43.55 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  44.58 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  42.69 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  42.01 
 
 		 371 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  32.68 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  31.27 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  29.88 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  32.12 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  30.95 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  31.38 
 
 		 353 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  34.1 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  31.6 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  31.01 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  32.02 
 
 		 363 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  30.88 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  31.46 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  33.76 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  29.84 
 
 		 392 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  31.01 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  29.36 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.73 
 
 		 391 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  30.94 
 
 		 365 aa  122  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  31.21 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 		 370 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  28.98 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  31.5 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 355 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  32.6 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  24.72 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  29.6 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  29.01 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.15 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.4 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  29.25 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  41.4 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  27.75 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  28.43 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  34.83 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  25.4 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>