More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1662 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  78.22 
 
 		 509 aa  857    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  78.22 
 
 		 510 aa  853    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  79.21 
 
 		 509 aa  865    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  71.85 
 
 		 511 aa  774    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  79.01 
 
 		 509 aa  865    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  79.41 
 
 		 508 aa  871    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 506 aa  1057    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  79.01 
 
 		 509 aa  867    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 632 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 648 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 651 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 650 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 647 aa  596  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 		 654 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 516 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 645 aa  588  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 518 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 653 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 655 aa  579  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 653 aa  578  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 650 aa  571  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 		 519 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 647 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 533 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 645 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 645 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 645 aa  551  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 659 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 650 aa  544  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 660 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 629 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 638 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 660 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 660 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 660 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 660 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 660 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 660 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 660 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 629 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 657 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 660 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 657 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 660 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 628 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 656 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 634 aa  529  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 634 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 648 aa  522  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 665 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 642 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 636 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 517 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 722 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  47.95 
 
 		 574 aa  494  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 538 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 666 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 644 aa  491  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 519 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 675 aa  484  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 541 aa  481  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 654 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 663 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 638 aa  479  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 659 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 648 aa  478  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 702 aa  478  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 667 aa  478  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 493 aa  481  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 544 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 624 aa  477  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 657 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 516 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 530 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3236  methionyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 523 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>