More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3992 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 535 aa  1113    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  69.88 
 
 		 530 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  66.41 
 
 		 525 aa  730    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  66.42 
 
 		 531 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  68.05 
 
 		 530 aa  782    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  70.46 
 
 		 533 aa  780    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  72.64 
 
 		 530 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 535 aa  1113    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14741  methionyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 515 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0426231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0342  methionyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.190132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10151  methionyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145983 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09931  methionyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0902215  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09951  methionyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0934  methionyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1334  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0404003 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09481  methionyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1140  methionyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 514 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.266684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 509 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 647 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08971  methionyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.931117  decreased coverage  0.000000449236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 648 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 629 aa  485  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 629 aa  485  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 511 aa  485  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 508 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 632 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 647 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 650 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 645 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 650 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 650 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 653 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 634 aa  464  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 628 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 653 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 493 aa  458  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 655 aa  458  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 645 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 645 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 654 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 519 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 634 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 645 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  43.64 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 638 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 506 aa  445  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 533 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 526 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 511 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 523 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 527 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 659 aa  435  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 660 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 660 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 525 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 660 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 530 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 660 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 665 aa  431  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 660 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 663 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 660 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 660 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 660 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 660 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 681 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 660 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 546 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 628 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 526 aa  423  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 515 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 522 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 550 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 656 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 624 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 628 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 541 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 539 aa  422  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 657 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 522 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 521 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>